225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0288 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 553 aa  1100    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  71.67 
 
 		 549 aa  723    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  66.91 
 
 		 558 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  68.56 
 
 		 545 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  80.83 
 
 		 553 aa  884    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  80.83 
 
 		 553 aa  885    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  66.36 
 
 		 552 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  84.78 
 
 		 554 aa  923    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  68.37 
 
 		 545 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  64.32 
 
 		 548 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  65.31 
 
 		 537 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  64.26 
 
 		 549 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  67.52 
 
 		 545 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  67.84 
 
 		 550 aa  703    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  67.52 
 
 		 547 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  62.89 
 
 		 556 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  98.01 
 
 		 553 aa  1080    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  94.76 
 
 		 552 aa  997    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  66.42 
 
 		 545 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  67.08 
 
 		 552 aa  666    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  70.48 
 
 		 575 aa  729    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  61.74 
 
 		 551 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  63.57 
 
 		 549 aa  656    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  99.46 
 
 		 553 aa  1095    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  66.36 
 
 		 552 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  70.48 
 
 		 575 aa  729    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  68.44 
 
 		 566 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  61.54 
 
 		 556 aa  624  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  60.89 
 
 		 553 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  59.67 
 
 		 538 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  60.11 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  57.8 
 
 		 467 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  58.91 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  59.11 
 
 		 467 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  59.63 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  57.4 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 463 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 		 464 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  47.13 
 
 		 455 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 464 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  41.86 
 
 		 507 aa  349  7e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 		 518 aa  343  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 448 aa  330  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  38.98 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 412 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  36.43 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 411 aa  243  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  35.96 
 
 		 406 aa  224  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  31.06 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  29.61 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  29.85 
 
 		 938 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 425 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 419 aa  123  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  35.96 
 
 		 679 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  28.23 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.11 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.65 
 
 		 410 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  29.24 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 421 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 421 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 421 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  28.07 
 
 		 430 aa  93.2  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 402 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 400 aa  90.5  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  24.52 
 
 		 400 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  24.52 
 
 		 402 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  24.52 
 
 		 402 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  24.41 
 
 		 404 aa  88.6  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  24.25 
 
 		 402 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  24.25 
 
 		 402 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  24.25 
 
 		 402 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  23.57 
 
 		 402 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 431 aa  87.4  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 434 aa  87.4  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.48 
 
 		 436 aa  87.4  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>