More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1495 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 319 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  95.61 
 
 		 319 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  41.35 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  41.21 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  41.67 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  42.01 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  41.67 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  38.12 
 
 		 320 aa  235  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  40.37 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  40.37 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  39.62 
 
 		 317 aa  228  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  38.12 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  37 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  37.7 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  39.2 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  35.69 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  36.62 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  37.12 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  37.42 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  37.22 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.17 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.84 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.9 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.02 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.46 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.13 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  33.16 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.77 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.7 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.77 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.23 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  32.62 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.01 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  29.26 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.36 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  28.89 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.24 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.28 
 
 		 589 aa  99.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.82 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.73 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.53 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  30.73 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0102  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.65 
 
 		 635 aa  96.3  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.32 
 
 		 354 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29 
 
 		 373 aa  95.9  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.33 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.69 
 
 		 613 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  35.39 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  28.19 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.08 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.95 
 
 		 695 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  29.44 
 
 		 390 aa  93.2  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.59 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.02 
 
 		 395 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30.46 
 
 		 575 aa  92.4  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.33 
 
 		 647 aa  92.4  9e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  34.27 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  34.27 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.85 
 
 		 562 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.76 
 
 		 732 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  26.86 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.38 
 
 		 560 aa  91.3  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.45 
 
 		 735 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.12 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.87 
 
 		 565 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.87 
 
 		 565 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.26 
 
 		 737 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  35.96 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.8 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  31.07 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 562 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 562 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 562 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 562 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  26.13 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 562 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 562 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  33.71 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 562 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  33.71 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  33.71 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 562 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.15 
 
 		 559 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.88 
 
 		 517 aa  90.1  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  29.55 
 
 		 391 aa  89.7  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.07 
 
 		 588 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  34.83 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  29.38 
 
 		 499 aa  89.7  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  34.83 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  26.85 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  33.71 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  34.83 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.43 
 
 		 644 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  34.27 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.65 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  27.75 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.56 
 
 		 575 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.35 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.35 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>