62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1245 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 342 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  96.49 
 
 		 342 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  50.45 
 
 		 336 aa  345  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  49.55 
 
 		 321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  55.39 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  48.65 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  38.14 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  37.24 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  37.91 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  36.64 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  33.24 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  33.24 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  33.53 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  32.4 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  30 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  30.23 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  31.5 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  30.53 
 
 		 318 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  28.52 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.46 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.69 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.55 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  22.19 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.3 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  21.67 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.01 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.02 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.72 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  21.72 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  22.79 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.89 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  21.15 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  23.96 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  21.08 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  22.8 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  20.54 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  21.75 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  21.45 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  21.23 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  21.39 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  21.39 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  21.39 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  21.39 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  21.39 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  22.8 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  21.69 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  24.61 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  20.99 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  21.54 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>