168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28914 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28914  formamidase  100 
 
 		 426 aa  882    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  69.44 
 
 		 411 aa  597  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  53.38 
 
 		 409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  53.83 
 
 		 406 aa  441  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  52.29 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  52.29 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  52.29 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  52.53 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  53.38 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  52.75 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  52.75 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  52.29 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  52.37 
 
 		 409 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  50.12 
 
 		 411 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  51.33 
 
 		 410 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  55.19 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  50.72 
 
 		 410 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  53.85 
 
 		 409 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  53 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  55.38 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  54.5 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  53.75 
 
 		 409 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  51.81 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  51.9 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  55.24 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  51.65 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  49.88 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  51.72 
 
 		 414 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  52 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  52.75 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  51.69 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  51.75 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  51.52 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  50.13 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  50.5 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  50.5 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  50.5 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  48.66 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  46.95 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  48.3 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  46.7 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  49.62 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  48.67 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  43.15 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  48.97 
 
 		 206 aa  187  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  32.47 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  34.02 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  30.61 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  29.43 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  28.8 
 
 		 318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  28.8 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.88 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.88 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.26 
 
 		 312 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  27.69 
 
 		 319 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  28.99 
 
 		 312 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  28.61 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  25.95 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  25.48 
 
 		 314 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  29.17 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  26.62 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  29.03 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  26.27 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  26.73 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  28.25 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  24.9 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  25.68 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  25.68 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  27.19 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  26 
 
 		 304 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  26 
 
 		 304 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  25.6 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  26 
 
 		 304 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  25.08 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  24.51 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  27.98 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  25.6 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  24.54 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  25.68 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  25.6 
 
 		 303 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  28.89 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  25.6 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  25.83 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  28.16 
 
 		 304 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  27.92 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  26.85 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  24.8 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  26.35 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  24.6 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  26.46 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  26.46 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  28.74 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  26.03 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  26.03 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  26.03 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  27.39 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 791 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  27.34 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  28.21 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  28.72 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>