More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51297 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_51297  predicted protein  100 
 
 		 345 aa  703    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24671  predicted protein  57.8 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.880693  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03490  malate dehydrogenase, putative  53.54 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06717  malate dehydrogenase (Eurofung)  54.04 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06499  malate dehydrogenase, NAD-dependent (AFU_orthologue; AFUA_6G05210)  53.19 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0415235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00736  malate dehydrogenase  55.94 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12282  predicted protein  54.15 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32875  predicted protein  55.35 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3622  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.817971  normal  0.609182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0672  malate dehydrogenase  56.56 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3657  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3551  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3550  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3719  malate dehydrogenase  54.06 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66451  mitochondrial malate dehydrogenase  53.08 
 
 		 332 aa  315  7e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0539  malate dehydrogenase  53.92 
 
 		 311 aa  315  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3671  malate dehydrogenase  53.44 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.306817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0469  malate dehydrogenase  54.69 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000123185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0470  malate dehydrogenase  54.06 
 
 		 312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.127263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03096  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0470  malate dehydrogenase, NAD-dependent  54.37 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3719  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0322257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3425  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.672879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3540  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03047  hypothetical protein  54.37 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4553  malate dehydrogenase  54.37 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0724333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0850  malate dehydrogenase  55.49 
 
 		 311 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3532  malate dehydrogenase  54.06 
 
 		 312 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.45791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3219  malate dehydrogenase  54.55 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00795  malate dehydrogenase  55.66 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3339  malate dehydrogenase  54.86 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0614  malate dehydrogenase  54.86 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3509  malate dehydrogenase  54.86 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0303223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1002  malate dehydrogenase  55.17 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000312167  hitchhiker  0.0000277575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0770  malate dehydrogenase  54.55 
 
 		 311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4514  malate dehydrogenase  52.83 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001676  malate dehydrogenase  55.03 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000765273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3173  malate dehydrogenase  54.55 
 
 		 311 aa  308  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0609  malate dehydrogenase  53.92 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3627  malate dehydrogenase  53.92 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.454276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3685  malate dehydrogenase  53.92 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0867  malate dehydrogenase  54.55 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000793131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3809  malate dehydrogenase  53.61 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2850  malate dehydrogenase  54.97 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.371941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0826  malate dehydrogenase  53.29 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0359  malate dehydrogenase  54.06 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000905728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0952  malate dehydrogenase  53.92 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0373108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0553  malate dehydrogenase  51.88 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3484  malate dehydrogenase  51.56 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000124556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0788  malate dehydrogenase  51.56 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000050316  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1055  malate dehydrogenase  54.55 
 
 		 311 aa  301  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000618832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3365  malate dehydrogenase  53.12 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000174685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3761  malate dehydrogenase  51.56 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.420142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3971  malate dehydrogenase  51.56 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3616  malate dehydrogenase  51.56 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606227  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03100  L-malate dehydrogenase, putative  53.55 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116944  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40132  NAD-dependent malate dehydrogenase  48.22 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.019207 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05031  conserved hypothetical protein: similar to cytplasmic malate dehydrogenase (Eurofung)  47.15 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.702277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0297  malate dehydrogenase  51.25 
 
 		 319 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78343  malate dehydrogenase  46.51 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.25351  decreased coverage  0.000277635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  30.43 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  30.61 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  29.91 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  30.4 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  30.09 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  30.34 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  30.82 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  30.53 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  30.89 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  30.84 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.6 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  30.84 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  30.84 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  33.19 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.01 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  32.57 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.87 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  31.53 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  30.28 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  31.25 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  31.46 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  28.24 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  31.14 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  32.08 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.91 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.4 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  31.56 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.4 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.18 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  31.06 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  32.67 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>