More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27877 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_27877  predicted protein  100 
 
 		 521 aa  1051    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  55.56 
 
 		 539 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11128  predicted protein  57.21 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13418  predicted protein  56.98 
 
 		 437 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1813  predicted protein  58.43 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229105  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10881  predicted protein  56.12 
 
 		 434 aa  465  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_1862  predicted protein  54.52 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  46.83 
 
 		 433 aa  339  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  47.4 
 
 		 471 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  46.24 
 
 		 478 aa  291  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  45.7 
 
 		 478 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  41.7 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  38.17 
 
 		 525 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  40 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  38.61 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  41.22 
 
 		 461 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  38.88 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  40.66 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  40.82 
 
 		 461 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  35.25 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  38.26 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  38.75 
 
 		 515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  38.75 
 
 		 515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  39.54 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  41.2 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  42.41 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  41.2 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  42.05 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  39.6 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  41.03 
 
 		 441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  40.17 
 
 		 449 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  38.54 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  36.92 
 
 		 441 aa  234  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  40.38 
 
 		 414 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.56 
 
 		 1262 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  37.25 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  36.55 
 
 		 483 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  37.95 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  33.4 
 
 		 1209 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  37.26 
 
 		 497 aa  223  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45928  Amt family transporter: ammonium  33.48 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.401156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  38.58 
 
 		 408 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  36.51 
 
 		 584 aa  220  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  36.9 
 
 		 518 aa  219  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  34.4 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  34.02 
 
 		 541 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  36.51 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  36.47 
 
 		 476 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  35.43 
 
 		 441 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  36.81 
 
 		 416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  36.55 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  36.81 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  36.81 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  36.62 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  37.21 
 
 		 408 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  39.47 
 
 		 426 aa  213  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  36.16 
 
 		 416 aa  213  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.61 
 
 		 1016 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  35.54 
 
 		 411 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  42.45 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  37 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  37.09 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  41.08 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  37.58 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  41.08 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  41.08 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  35.29 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  35.75 
 
 		 478 aa  207  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  40.77 
 
 		 417 aa  206  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  36.81 
 
 		 509 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  40.79 
 
 		 416 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  41.53 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  34.12 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  35.03 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  35.39 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  34.78 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  36.63 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.72 
 
 		 1018 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 717 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  35.03 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  39.73 
 
 		 417 aa  204  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  35.86 
 
 		 488 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  35.47 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  34.81 
 
 		 507 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  34.93 
 
 		 437 aa  203  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  35.16 
 
 		 408 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  40.39 
 
 		 416 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  37.67 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  34.93 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  36.88 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1788  Rh-like protein/ammonium transporter  33.92 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  36.16 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  36.22 
 
 		 490 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  34.45 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  35.46 
 
 		 451 aa  200  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  33.54 
 
 		 1322 aa  200  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  33.56 
 
 		 474 aa  200  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  35.08 
 
 		 486 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  36.18 
 
 		 496 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  36.18 
 
 		 496 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>