More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20015 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_20015  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41053  predicted protein  54.75 
 
 
231 aa  250  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  49.11 
 
 
232 aa  228  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07588  ribulose-phosphate 3-epimerase (AFU_orthologue; AFUA_2G15190)  45.38 
 
 
252 aa  216  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337987  normal  0.331774 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06630  ribulose-phosphate 3-epimerase, putative  42.66 
 
 
224 aa  193  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
216 aa  181  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.75 
 
 
224 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17265  predicted protein  46.31 
 
 
204 aa  180  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27529  hitchhiker  0.00915674 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 
219 aa  179  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.91 
 
 
217 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.82 
 
 
219 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0833  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.26 
 
 
216 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
211 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3605  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.11 
 
 
218 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
225 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.91 
 
 
225 aa  175  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
223 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.36 
 
 
229 aa  175  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.47 
 
 
231 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.45 
 
 
236 aa  174  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.4 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.4 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.4 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.4 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.58 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.19 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.26 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.45 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3188  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.2 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000178171  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.44 
 
 
236 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.15 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  39.19 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.26 
 
 
232 aa  171  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.82 
 
 
225 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 
217 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
219 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.81 
 
 
225 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.53 
 
 
225 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 
228 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.44 
 
 
223 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.18 
 
 
218 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.81 
 
 
225 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4448  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.07 
 
 
230 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
214 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.54 
 
 
225 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
214 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
214 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
214 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
214 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
214 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 
223 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
214 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  39.82 
 
 
225 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
214 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.53 
 
 
225 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.99 
 
 
224 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.9 
 
 
228 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.26 
 
 
225 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.47 
 
 
223 aa  168  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.93 
 
 
236 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.99 
 
 
224 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.99 
 
 
224 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
223 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.99 
 
 
224 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.44 
 
 
223 aa  168  7e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.53 
 
 
214 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  39.91 
 
 
239 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0381  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.28 
 
 
223 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 
224 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.53 
 
 
214 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  39.64 
 
 
224 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.81 
 
 
228 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.53 
 
 
214 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.78 
 
 
225 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1653  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.13 
 
 
217 aa  166  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 
230 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.09 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.37 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1276  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.65 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0486959  normal  0.303608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.74 
 
 
225 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
225 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
225 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  38.43 
 
 
220 aa  165  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.64 
 
 
216 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
225 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.36 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.09 
 
 
228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.64 
 
 
222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.47 
 
 
230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1370  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.47 
 
 
219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152039  normal  0.078192 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10820  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.36 
 
 
223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00879281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>