More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4072 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  60.63 
 
 
541 aa  679    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
560 aa  1127    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  63.43 
 
 
548 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  60.22 
 
 
546 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  63.25 
 
 
553 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  60.42 
 
 
539 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  62.19 
 
 
559 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  70.67 
 
 
575 aa  812    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  58.96 
 
 
556 aa  675    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  60.59 
 
 
555 aa  674    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  60.78 
 
 
541 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  67.41 
 
 
541 aa  745    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  70.86 
 
 
564 aa  815    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  62 
 
 
552 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  59.45 
 
 
546 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  81.85 
 
 
555 aa  965    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  81.85 
 
 
555 aa  965    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  58.3 
 
 
558 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  60.73 
 
 
541 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  70.63 
 
 
587 aa  764    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  60.63 
 
 
590 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  56.8 
 
 
555 aa  628  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  56.27 
 
 
562 aa  626  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  55 
 
 
555 aa  621  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  55.68 
 
 
559 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  55.58 
 
 
565 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  55.32 
 
 
554 aa  606  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  55.6 
 
 
553 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  52.8 
 
 
562 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  51.3 
 
 
638 aa  548  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  53.79 
 
 
563 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  50.47 
 
 
615 aa  524  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  49.05 
 
 
566 aa  511  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  49.52 
 
 
563 aa  502  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  51.04 
 
 
641 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  48.7 
 
 
542 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  48.92 
 
 
641 aa  497  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  49.9 
 
 
534 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  49.62 
 
 
535 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  49.62 
 
 
535 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  49.62 
 
 
535 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  49.62 
 
 
535 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  48.84 
 
 
543 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  49.42 
 
 
535 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  49.62 
 
 
535 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  49.14 
 
 
544 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  49.62 
 
 
537 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  49.62 
 
 
535 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  49.23 
 
 
537 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  49.81 
 
 
535 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  49.81 
 
 
535 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  49.03 
 
 
526 aa  487  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  49.81 
 
 
535 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  49.62 
 
 
537 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  49.42 
 
 
535 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  49.42 
 
 
535 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  49.81 
 
 
535 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  49.61 
 
 
535 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  49.81 
 
 
535 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  49.23 
 
 
530 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  49.32 
 
 
529 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  49.32 
 
 
529 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  49.12 
 
 
529 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  48.26 
 
 
547 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  49.1 
 
 
530 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  49.3 
 
 
527 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  48.56 
 
 
561 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  49.71 
 
 
536 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  50.1 
 
 
534 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  48.67 
 
 
594 aa  482  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  49.12 
 
 
529 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  49.9 
 
 
534 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  50 
 
 
569 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  48.22 
 
 
594 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  49.42 
 
 
529 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  48.64 
 
 
543 aa  478  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  48.83 
 
 
539 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  48.66 
 
 
556 aa  478  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  48.34 
 
 
530 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  49.7 
 
 
527 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  47.26 
 
 
582 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  48.78 
 
 
581 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  48.53 
 
 
530 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  49.62 
 
 
596 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  49.2 
 
 
541 aa  475  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  45.16 
 
 
585 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  48.24 
 
 
535 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  48.14 
 
 
572 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  50.9 
 
 
526 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  47.67 
 
 
539 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  47.91 
 
 
555 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  51.19 
 
 
589 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  47.87 
 
 
544 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  47.87 
 
 
544 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  50.48 
 
 
540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  47.78 
 
 
544 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  49.44 
 
 
534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  47.67 
 
 
543 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  48.26 
 
 
526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  47.64 
 
 
593 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>