127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1155    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2310  hypothetical protein  75.09 
 
 
601 aa  828    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0333269  hitchhiker  0.0000166266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  98.6 
 
 
570 aa  1140    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1319  protein of unknown function DUF323  32.13 
 
 
569 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  33.99 
 
 
508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  32.33 
 
 
511 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4233  hypothetical protein  33.4 
 
 
511 aa  220  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0277487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  31.94 
 
 
520 aa  211  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  29.29 
 
 
515 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  29.62 
 
 
502 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4058  hypothetical protein  33.81 
 
 
545 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3148  hypothetical protein  32.86 
 
 
515 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.358064  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0903  hypothetical protein  31.79 
 
 
537 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0493505  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3222  protein of unknown function DUF323  30.72 
 
 
512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33154  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3420  hypothetical protein  33.04 
 
 
538 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3870  hypothetical protein  33.04 
 
 
538 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0563781  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3133  hypothetical protein  32.54 
 
 
538 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1667  hypothetical protein  27.98 
 
 
569 aa  134  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  30.7 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  31.49 
 
 
245 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  29.63 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  36.63 
 
 
336 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  29.82 
 
 
293 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  28.4 
 
 
413 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  29.55 
 
 
276 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  31.09 
 
 
223 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  29.18 
 
 
262 aa  60.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  27.18 
 
 
334 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  35.64 
 
 
293 aa  58.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  27.87 
 
 
491 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  29.06 
 
 
586 aa  57.4  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 
289 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 
263 aa  57.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  33.33 
 
 
341 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  26.24 
 
 
225 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  35.05 
 
 
329 aa  55.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  23.08 
 
 
587 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.87 
 
 
654 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  29.12 
 
 
282 aa  55.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  26.32 
 
 
446 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.69 
 
 
657 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  35.11 
 
 
366 aa  53.9  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  26.36 
 
 
535 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  29.35 
 
 
327 aa  53.9  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  39.13 
 
 
299 aa  53.9  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 
308 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  34.44 
 
 
359 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  28.52 
 
 
523 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  26.78 
 
 
570 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  31.68 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  24.69 
 
 
225 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
715 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  26.62 
 
 
276 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  24.69 
 
 
226 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  32.05 
 
 
356 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  27.75 
 
 
663 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  32.17 
 
 
298 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.03 
 
 
616 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  24.69 
 
 
226 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  40.91 
 
 
262 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  28.45 
 
 
611 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  28.43 
 
 
337 aa  50.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  24.71 
 
 
214 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 
270 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  27.53 
 
 
488 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  26.64 
 
 
301 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  26.05 
 
 
740 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  36.17 
 
 
201 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  27.03 
 
 
551 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  30.11 
 
 
768 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
321 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  33.64 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  38.2 
 
 
361 aa  48.9  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  35.29 
 
 
296 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  28.89 
 
 
401 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  32.88 
 
 
1053 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
330 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  30.77 
 
 
370 aa  48.5  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 
323 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  34.74 
 
 
384 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 
319 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  24.59 
 
 
226 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  26.56 
 
 
230 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  35.96 
 
 
320 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.95 
 
 
331 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  33.06 
 
 
352 aa  47.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04718  lipoprotein, putative  35.96 
 
 
282 aa  47.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0504656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  29.48 
 
 
349 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  26.14 
 
 
952 aa  47.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 
279 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  35.71 
 
 
1183 aa  47  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  38.14 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  34.34 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  24.39 
 
 
294 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  28.12 
 
 
922 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  29.59 
 
 
292 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  29.6 
 
 
237 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>