More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21101 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  100 
 
 		 428 aa  876    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  68.54 
 
 		 388 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  68.54 
 
 		 400 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  62.21 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  56.85 
 
 		 400 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  56.85 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  46.06 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  45.8 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  45.66 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  45.8 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  41.73 
 
 		 392 aa  316  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 395 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  40.85 
 
 		 415 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  38.89 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  39.39 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  39.8 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.74 
 
 		 367 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.06 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  31.86 
 
 		 287 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  26.96 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  26.98 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  27.37 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  25.19 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  27.3 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  24.63 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  24.82 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.1 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  22.54 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.74 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.55 
 
 		 678 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  25.08 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.41 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  26.25 
 
 		 391 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.45 
 
 		 393 aa  93.2  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  25.2 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.12 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  23.6 
 
 		 896 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.53 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.38 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  26.65 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  29.67 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  22.42 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  26.53 
 
 		 380 aa  89.7  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  24.17 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.63 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  30 
 
 		 392 aa  87.4  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  25.22 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.55 
 
 		 382 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  25.61 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.42 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.64 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.78 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  22.42 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.36 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  24.8 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  27.19 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  25.07 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  25.42 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.66 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  29.18 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  25.43 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  26.37 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  28.96 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.1 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  26.69 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.84 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  29.14 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.81 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  28.89 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  24.92 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  28.65 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.93 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  29.05 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.94 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  23.83 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  25.85 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.18 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.12 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  29.59 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  22.14 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.92 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  25.34 
 
 		 604 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  25.26 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  25.34 
 
 		 604 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  25.12 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  24.93 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  27.93 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  24.21 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  26.77 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  26.1 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  26.78 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  25.3 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.79 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  25.16 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.31 
 
 		 644 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  23.46 
 
 		 682 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  29.62 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  30.52 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>