More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1512 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  778    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  46.11 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  45.24 
 
 		 393 aa  332  8e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  42.93 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  44.62 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  44.74 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  38.18 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  37.5 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  39.74 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  40.31 
 
 		 388 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  36.96 
 
 		 388 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  38.32 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  37.5 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  37.5 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  37.5 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.23 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  37.27 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  36.77 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  36.16 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  36.68 
 
 		 388 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 		 387 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  40.62 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  37.43 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  37.43 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  35.6 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  35.08 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  38.27 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  36.46 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.33 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  28.36 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.42 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.4 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 430 aa  72.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.93 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.57 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.83 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.74 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.23 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.93 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  23.86 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  25.25 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 		 454 aa  67  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.42 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.2 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  27.18 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 856 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.59 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.69 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  23.2 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.27 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.87 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  22.8 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.15 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.4 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  23.4 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  23.4 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.81 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  24.76 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  21.84 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  27.08 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.43 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  26.06 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  33.75 
 
 		 843 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  26 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.58 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  25.5 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  33.54 
 
 		 842 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.47 
 
 		 648 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.19 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0571  hypothetical protein  26.97 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  23.99 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  26.67 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  26.67 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  24.22 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  26.69 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  26.75 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  23.69 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  25.5 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.27 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.8 
 
 		 649 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.68 
 
 		 656 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  25.91 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  23.65 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  32.08 
 
 		 647 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>