More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1418 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  65.22 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0270  50S ribosomal protein L1  69.13 
 
 		 230 aa  309  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000998877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 235 aa  266  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  54.87 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  52.47 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 232 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  52.02 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  53.12 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 238 aa  241  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 236 aa  237  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  47.44 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 232 aa  234  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  46.26 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  48.21 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 225 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  48.23 
 
 		 232 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  53.1 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  51.58 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  51.79 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  50.7 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  50.7 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  50.7 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  47.35 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  46.52 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  48.26 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  47.09 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  48.05 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  48.26 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  48.26 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  52.23 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  51.64 
 
 		 229 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>