More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0596 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  4.75036e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  67.49 
 
 
207 aa  285  3e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 
207 aa  266  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  9.84788e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  60.68 
 
 
207 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.23482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  58.25 
 
 
207 aa  258  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  59.22 
 
 
207 aa  254  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.04823e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  254  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.44936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.63463e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.56275e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.34057e-10  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.00585e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.36863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.90155e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  58.74 
 
 
207 aa  253  1e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.72324e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  58.25 
 
 
207 aa  252  2e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  57 
 
 
207 aa  252  4e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  9.811e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  57 
 
 
207 aa  252  4e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.34967e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  59.42 
 
 
208 aa  251  7e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  55.83 
 
 
207 aa  240  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  55.83 
 
 
207 aa  239  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.35339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  54.37 
 
 
205 aa  226  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.72593e-05  unclonable  1.97161e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  54.37 
 
 
207 aa  224  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 
206 aa  218  4e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  52.91 
 
 
206 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.20704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  48.29 
 
 
206 aa  207  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 
206 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.85593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  49.03 
 
 
207 aa  203  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.47375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  48.79 
 
 
207 aa  202  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  48.54 
 
 
207 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.03747e-05  hitchhiker  2.67396e-11 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  48.54 
 
 
207 aa  202  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 
206 aa  200  1e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.69503e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  48.54 
 
 
207 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 
208 aa  195  4e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.79055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  47.09 
 
 
206 aa  194  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  2.54915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  45.7 
 
 
221 aa  194  7e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.11144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 
207 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.03712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.69 
 
 
207 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  1.46284e-08 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  46.86 
 
 
209 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 
207 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.66858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  44.88 
 
 
223 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 
204 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  44.88 
 
 
204 aa  183  1e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  41.06 
 
 
208 aa  182  4e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.99505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 
208 aa  182  4e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  43.44 
 
 
221 aa  181  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 
208 aa  181  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.18286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  47.12 
 
 
208 aa  180  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.38717e-07  hitchhiker  5.90673e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  47.09 
 
 
207 aa  180  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  4.5126e-06  hitchhiker  1.48432e-09 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  42.99 
 
 
223 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.24266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  46.12 
 
 
207 aa  178  5e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.91532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  46.39 
 
 
223 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  45.93 
 
 
222 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 
206 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  45.88 
 
 
221 aa  174  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.17748e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 
207 aa  174  1e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  44.66 
 
 
207 aa  172  2e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.92239e-05  decreased coverage  1.22182e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 
207 aa  173  2e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 
206 aa  173  2e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.29639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 
210 aa  172  2e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 
206 aa  172  3e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
206 aa  172  3e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 
205 aa  171  7e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 
220 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.30014e-06  hitchhiker  3.1805e-13 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  45.97 
 
 
212 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  42.64 
 
 
208 aa  167  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.04234e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 
206 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  44.33 
 
 
209 aa  166  3e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 
207 aa  166  3e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.51414e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  41.88 
 
 
201 aa  166  3e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  4.27281e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 
207 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 
209 aa  165  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3908  50S ribosomal protein L4  43.43 
 
 
200 aa  164  7e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 
206 aa  162  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 
210 aa  163  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  5.86581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  42.92 
 
 
235 aa  163  2e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  8.03665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  42.92 
 
 
235 aa  163  2e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 
206 aa  163  2e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  40.19 
 
 
210 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  43.01 
 
 
200 aa  161  8e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.16803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 
210 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08860  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 
200 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00776029  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 
200 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  42.31 
 
 
216 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2173  50S ribosomal protein L4  42.49 
 
 
200 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.74601e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  38.28 
 
 
211 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  42.64 
 
 
202 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0485  50S ribosomal protein L4  42.63 
 
 
200 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  2.38586e-06  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  38.28 
 
 
211 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  41.83 
 
 
216 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  37.91 
 
 
212 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  38.54 
 
 
210 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
218 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0485  50S ribosomal protein L4  41.88 
 
 
200 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 
215 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  42.49 
 
 
200 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 
207 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  43.16 
 
 
200 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.09229e-10  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4748  50S ribosomal protein L4  41.88 
 
 
200 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  7.4471e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>