48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0257 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  49.14 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  31.36 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  31.87 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  33.33 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  36.19 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1526 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  30.14 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  34.04 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  29.93 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  33.03 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  33.03 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.9 
 
 		 1363 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  29.73 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  30.49 
 
 		 1048 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  33.04 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4785  hypothetical protein  37.97 
 
 		 84 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  32.61 
 
 		 1348 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  30.16 
 
 		 137 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  34.83 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  27.71 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  25.82 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  28.93 
 
 		 513 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  28.45 
 
 		 303 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.4 
 
 		 1656 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 357 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  31.09 
 
 		 265 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  32.32 
 
 		 570 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  22.9 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  26.85 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.62 
 
 		 1373 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  22.81 
 
 		 969 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  30.14 
 
 		 1611 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.67 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  28.8 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  25.26 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  30 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  32.05 
 
 		 138 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  31.03 
 
 		 157 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1068 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  29.41 
 
 		 797 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  31.71 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 850 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  25 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  24.37 
 
 		 323 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>