More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0093 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  100 
 
 
460 aa  937  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.61 
 
 
443 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  39.41 
 
 
435 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  35.7 
 
 
443 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  36 
 
 
448 aa  310  3e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3798  Fe-S cluster domain-containing protein  37.24 
 
 
427 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.818918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0692  Fe-S cluster domain protein  33.92 
 
 
434 aa  262  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  32.9 
 
 
443 aa  254  2e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28 
 
 
748 aa  153  6e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.52259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  26.23 
 
 
584 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  25.34 
 
 
583 aa  142  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  27.46 
 
 
571 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 
574 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  27.06 
 
 
580 aa  137  3e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  26.47 
 
 
759 aa  135  1e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.7 
 
 
759 aa  135  2e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  25.51 
 
 
576 aa  135  2e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27 
 
 
756 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  28.28 
 
 
767 aa  130  5e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.47 
 
 
542 aa  130  7e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  26.5 
 
 
763 aa  129  1e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  26.09 
 
 
755 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  6.48689e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  25.28 
 
 
577 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  24.71 
 
 
752 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.34 
 
 
521 aa  123  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000641444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.56 
 
 
521 aa  122  2e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.56 
 
 
519 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  25.6 
 
 
572 aa  120  4e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.94 
 
 
550 aa  118  2e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 
573 aa  116  8e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  24.55 
 
 
569 aa  115  1e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  26.83 
 
 
559 aa  115  2e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  2.02467e-11 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  25.11 
 
 
877 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2312  Fe binding transcriptional regulator FhlA  24.34 
 
 
747 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  24.07 
 
 
556 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  26 
 
 
491 aa  97.8  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  25.83 
 
 
462 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  25.54 
 
 
507 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  24.14 
 
 
572 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  24.14 
 
 
572 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  25.86 
 
 
696 aa  90.9  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  22.42 
 
 
485 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  27.36 
 
 
478 aa  84  5e-15  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  27.36 
 
 
454 aa  83.2  9e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95829e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  24.18 
 
 
493 aa  82.8  1e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  24.43 
 
 
567 aa  83.2  1e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  25.36 
 
 
508 aa  80.9  4e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  8.70686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  23.6 
 
 
483 aa  80.9  5e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  6.65726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  24.08 
 
 
460 aa  80.1  7e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  23.04 
 
 
581 aa  79.7  1e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  8.65974e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  23.45 
 
 
435 aa  79.3  1e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  26.21 
 
 
488 aa  79.3  1e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  23.75 
 
 
562 aa  79  2e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  22.4 
 
 
410 aa  78.6  2e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  22.4 
 
 
410 aa  78.6  2e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  8.73565e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  22.4 
 
 
410 aa  78.2  3e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  1.63586e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  23.77 
 
 
462 aa  75.9  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  21.29 
 
 
667 aa  75.5  2e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  25.45 
 
 
659 aa  74.3  4e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  21.95 
 
 
574 aa  74.3  5e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  23.98 
 
 
490 aa  74.3  5e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.19307e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  22.22 
 
 
645 aa  73.9  6e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  22.22 
 
 
645 aa  73.9  6e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  24.66 
 
 
387 aa  73.9  6e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  24.28 
 
 
666 aa  73.6  7e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  25.34 
 
 
666 aa  73.6  7e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  23.64 
 
 
421 aa  73.6  8e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2305  ferredoxin 2  23.67 
 
 
500 aa  73.2  9e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  23.24 
 
 
582 aa  72.8  1e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  23.06 
 
 
1150 aa  73.2  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  24.63 
 
 
490 aa  72  2e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  26.55 
 
 
569 aa  71.6  2e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  2.53121e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  26.87 
 
 
527 aa  72.4  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  25.37 
 
 
531 aa  71.6  3e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  24.19 
 
 
576 aa  71.2  3e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  22.65 
 
 
569 aa  71.6  3e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  22.06 
 
 
582 aa  71.2  4e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  23.48 
 
 
570 aa  70.9  5e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  22.75 
 
 
482 aa  70.1  8e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.19385e-05  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  25.33 
 
 
596 aa  70.1  8e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  24.15 
 
 
582 aa  70.1  8e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  22.92 
 
 
456 aa  69.3  1e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  23.05 
 
 
579 aa  69.7  1e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  25.4 
 
 
594 aa  69.3  1e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  22.42 
 
 
653 aa  69.3  1e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  25.53 
 
 
573 aa  68.9  2e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  24.57 
 
 
590 aa  68.6  2e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  25.45 
 
 
586 aa  68.9  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  23.21 
 
 
490 aa  68.6  2e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  21.07 
 
 
520 aa  68.2  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  24.27 
 
 
582 aa  67.8  4e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  25.42 
 
 
601 aa  67.8  4e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  26.19 
 
 
421 aa  67.8  4e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  22.73 
 
 
625 aa  67.4  6e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  24.3 
 
 
582 aa  67  7e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  25.33 
 
 
582 aa  66.6  8e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  22.37 
 
 
418 aa  66.6  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  23.83 
 
 
582 aa  66.2  1e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  26.97 
 
 
573 aa  66.2  1e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  21.66 
 
 
578 aa  65.9  1e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>