172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2357 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
243 aa  481  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  50.85 
 
 
242 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  36.67 
 
 
295 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  42.2 
 
 
272 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  42.2 
 
 
272 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  41.38 
 
 
260 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  41.38 
 
 
254 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  41.38 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  38.74 
 
 
307 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  40.8 
 
 
263 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  39.49 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  34.85 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
334 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  34.29 
 
 
268 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  33.47 
 
 
267 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  40.23 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  35.95 
 
 
316 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  35.95 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  37.01 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  32.95 
 
 
324 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  36.84 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  34.38 
 
 
266 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  36.54 
 
 
226 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  27.64 
 
 
316 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  27.24 
 
 
316 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 
403 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  36.84 
 
 
338 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  36.18 
 
 
338 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  36.18 
 
 
338 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  34.48 
 
 
316 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  34.34 
 
 
209 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  35.53 
 
 
338 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 
260 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  31.62 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.15 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  33.74 
 
 
201 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  29.38 
 
 
266 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  26.89 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  37.2 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 
251 aa  92  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  35.76 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  27.69 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  32.91 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  32.08 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  27.11 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  34.5 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  32.28 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  32.28 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  27.84 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  32.72 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  29.51 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  30.87 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  30.81 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  31.01 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  27.16 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  27.22 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  32.89 
 
 
349 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  27.22 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  32.58 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  27.54 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  33.1 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  29.75 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  29.75 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  29.14 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  29.45 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.48 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  30.82 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  29.87 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  28.93 
 
 
207 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  30.82 
 
 
227 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  28.81 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  38.22 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  34.17 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  27.97 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  35.62 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  29.48 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  29.48 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  29.49 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  29.17 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  29.53 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  29.87 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  28.39 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  26.22 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  28.39 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  26.35 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  29.56 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>