More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1903 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  67.53 
 
 		 637 aa  777    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  100 
 
 		 629 aa  1275    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.25 
 
 		 647 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.67 
 
 		 607 aa  594  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 		 610 aa  588  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 		 610 aa  586  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.45 
 
 		 630 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.49 
 
 		 618 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.06 
 
 		 618 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  52.41 
 
 		 621 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.7 
 
 		 639 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.45 
 
 		 617 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  49.67 
 
 		 646 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.53 
 
 		 614 aa  572  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.22 
 
 		 686 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  47.9 
 
 		 630 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 607 aa  568  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  52.23 
 
 		 618 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 		 696 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  49.18 
 
 		 615 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 		 714 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  50.5 
 
 		 616 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.35 
 
 		 602 aa  568  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  49.1 
 
 		 702 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.18 
 
 		 705 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 		 706 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 617 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 		 607 aa  562  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.07 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 		 614 aa  562  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.18 
 
 		 663 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.18 
 
 		 663 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.85 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.77 
 
 		 630 aa  559  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.69 
 
 		 646 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 676 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.69 
 
 		 646 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.38 
 
 		 699 aa  559  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 		 687 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.45 
 
 		 697 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.55 
 
 		 697 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.36 
 
 		 615 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 		 620 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.92 
 
 		 625 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.24 
 
 		 640 aa  554  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  48.12 
 
 		 624 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  49.17 
 
 		 692 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  47.71 
 
 		 706 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.23 
 
 		 694 aa  552  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  48.13 
 
 		 620 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  48.47 
 
 		 625 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  49.5 
 
 		 637 aa  554  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  48.52 
 
 		 619 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.91 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.49 
 
 		 621 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.74 
 
 		 637 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 658 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.93 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 		 611 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.38 
 
 		 653 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  48.12 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.99 
 
 		 640 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.85 
 
 		 645 aa  547  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.01 
 
 		 612 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  49.16 
 
 		 616 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  46.85 
 
 		 699 aa  548  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 		 612 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.89 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  48.41 
 
 		 681 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  49.26 
 
 		 623 aa  547  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 655 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.58 
 
 		 640 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 		 633 aa  548  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 655 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.93 
 
 		 652 aa  548  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.1 
 
 		 645 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  47.8 
 
 		 620 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.32 
 
 		 642 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  48.37 
 
 		 629 aa  545  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.99 
 
 		 640 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.49 
 
 		 642 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.49 
 
 		 642 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.56 
 
 		 653 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.79 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.49 
 
 		 640 aa  545  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  47.73 
 
 		 694 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 		 610 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  52.11 
 
 		 617 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  47.8 
 
 		 620 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  48.82 
 
 		 917 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.94 
 
 		 638 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  48.81 
 
 		 605 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.33 
 
 		 717 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.25 
 
 		 713 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  49.02 
 
 		 621 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.82 
 
 		 666 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.9 
 
 		 605 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.07 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>