211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0322 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 408 aa  825    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  36.22 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  30.37 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  30.03 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  29.05 
 
 		 408 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  28.46 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  25.45 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  29.35 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.69 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  26.29 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.54 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  28.17 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.81 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  27.37 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.13 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  25.61 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  23.48 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.19 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.55 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  26.32 
 
 		 430 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  25.89 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.63 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.23 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  25.39 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  21.41 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  24.94 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.43 
 
 		 435 aa  96.3  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  25.24 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  25.42 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.49 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.96 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  22.75 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  21.71 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  23.34 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  24.38 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  22.89 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  26.24 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  25.83 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  26.15 
 
 		 382 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  24.64 
 
 		 454 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  27.23 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  26 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  26.91 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2884  hypothetical protein  22.74 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179346  hitchhiker  0.000404668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.45 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  24.29 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  27.66 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.94 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  28.79 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  23.99 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  24.88 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  22.53 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  26.68 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  20.15 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.42 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.31 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32750  hypothetical protein  25.9 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196352  hitchhiker  0.0000232684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  27.08 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.42 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.5 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  23.19 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  23.11 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.87 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  27.11 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.9 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  23.84 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  23.75 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  23.75 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.68 
 
 		 842 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.23 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  24.22 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1822  hypothetical protein  25.61 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  25.32 
 
 		 844 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  25.7 
 
 		 850 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  18.98 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  23.27 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  24.23 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.51 
 
 		 850 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.99 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.89 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  25.41 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  22.81 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  24.55 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.59 
 
 		 850 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  23.52 
 
 		 470 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  24.87 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1117 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.96 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.06 
 
 		 843 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  23.53 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  22.78 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  24.42 
 
 		 783 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.62 
 
 		 840 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  22.22 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  21.36 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.89 
 
 		 850 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  21.98 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>