48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1779 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1779  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.787472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 213 aa  207  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  47.49 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  47.49 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4516  hypothetical protein  49.14 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00440  Transcriptional regulatory protein TetR family  51.88 
 
 		 188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0088  TetR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  29.76 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  28.18 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  28.57 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  26.47 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  29.56 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  27.89 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  24.35 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  24.16 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  32.79 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  40 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  23.03 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  28.21 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 218 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 188 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>