47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1527 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  76.7 
 
 
722 aa  1040  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  2.58397e-09 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  100 
 
 
722 aa  1410  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.97915e-10 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  52.16 
 
 
792 aa  674  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.53148e-09 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  40.44 
 
 
1987 aa  142  2e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  46.12 
 
 
637 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  42.44 
 
 
671 aa  124  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 
440 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  44.17 
 
 
374 aa  104  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  43.96 
 
 
490 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.26 
 
 
1755 aa  97.8  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  45.18 
 
 
623 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  44.19 
 
 
458 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  31.17 
 
 
478 aa  74.3  8e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  38.65 
 
 
259 aa  73.6  1e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.75 
 
 
420 aa  70.1  1e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.92 
 
 
320 aa  69.3  2e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.09 
 
 
447 aa  69.7  2e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.85785e-13  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 
487 aa  68.9  3e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  31.17 
 
 
727 aa  68.2  6e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 
456 aa  63.9  9e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.8 
 
 
428 aa  63.9  1e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.18101e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.5 
 
 
319 aa  61.6  5e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  6.51702e-11  n/a   
 
 
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 
417 aa  61.2  6e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.26931e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
342 aa  59.7  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  32.82 
 
 
386 aa  58.2  5e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  28.25 
 
 
2074 aa  58.2  5e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  33.17 
 
 
386 aa  57.4  9e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.96 
 
 
427 aa  57.4  1e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.5 
 
 
412 aa  56.6  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  30.48 
 
 
6109 aa  56.6  2e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
322 aa  56.2  2e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  7.28339e-10  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.79 
 
 
429 aa  55.8  3e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 
544 aa  55.5  4e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  29.58 
 
 
292 aa  55.1  4e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.02 
 
 
542 aa  55.1  4e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 
543 aa  54.7  6e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  37.5 
 
 
402 aa  53.9  1e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  28.44 
 
 
14609 aa  51.6  5e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  37.3 
 
 
290 aa  51.2  7e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 
1264 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.11 
 
 
294 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.73 
 
 
4357 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  44.26 
 
 
366 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.48 
 
 
1707 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  31.97 
 
 
314 aa  46.6  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  38.06 
 
 
780 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  44.59 
 
 
602 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>