More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2671 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  88.32 
 
 		 389 aa  692    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  81.73 
 
 		 389 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  79.44 
 
 		 389 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  81.22 
 
 		 390 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  804    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  78.93 
 
 		 390 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  77.16 
 
 		 390 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  63.04 
 
 		 387 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  62.53 
 
 		 387 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  60.66 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  63.04 
 
 		 387 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  61.77 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  62.03 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  61.36 
 
 		 390 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  62.28 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  60.31 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  60.31 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  63.8 
 
 		 388 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  61.07 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  61.36 
 
 		 390 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  60 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  61.52 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  60.66 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  60.51 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  60.81 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  59.29 
 
 		 390 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  57.72 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  59.54 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  63.04 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  59.29 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  57.72 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  60.31 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  54.94 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  52.05 
 
 		 388 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  52.05 
 
 		 388 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  53.69 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.63 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.63 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  51.79 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  49.51 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.51 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.38 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.27 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.01 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  54.96 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  50.38 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.89 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  48.61 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  51.79 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  49.24 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  50.26 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  50.51 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  46.91 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  52.62 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  51.14 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.29 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.8 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.84 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.55 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  52.41 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  50.38 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  48.72 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.13 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.75 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.91 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  44.33 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  52.41 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  52.41 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  50.38 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  46.13 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.91 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  52.14 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  49.62 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  48.5 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  51.39 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.25 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.48 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.55 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  48.35 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  51.6 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  52.14 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  48.33 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  51.39 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  51.14 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.99 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.99 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.99 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  48.83 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  47.51 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>