More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3075 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
876 aa  671  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
865 aa  639  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 
876 aa  647  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
878 aa  655  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
874 aa  651  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
874 aa  639  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
874 aa  635  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
876 aa  635  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
874 aa  635  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
880 aa  676  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
877 aa  681  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
876 aa  650  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
897 aa  865  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
893 aa  836  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
879 aa  702  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 
898 aa  900  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86953e-08 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
889 aa  660  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
880 aa  639  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
881 aa  663  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
879 aa  662  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
884 aa  646  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
880 aa  636  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
880 aa  635  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
876 aa  635  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
892 aa  907  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
897 aa  635  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
879 aa  635  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
886 aa  670  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
886 aa  649  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
931 aa  658  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
876 aa  645  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
860 aa  637  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
880 aa  733  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 
892 aa  943  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 
898 aa  882  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
878 aa  719  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 
897 aa  862  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 
904 aa  867  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
893 aa  919  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
880 aa  642  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
878 aa  650  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 
892 aa  941  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66282e-05 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 
886 aa  952  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
878 aa  650  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
896 aa  891  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
892 aa  919  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
897 aa  865  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
892 aa  663  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 
898 aa  872  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
879 aa  637  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
886 aa  666  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
888 aa  1783  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
880 aa  636  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
880 aa  635  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
882 aa  681  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 
895 aa  934  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
900 aa  920  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  76.44 
 
 
889 aa  1365  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
874 aa  640  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
874 aa  645  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
891 aa  881  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 
889 aa  1046  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
878 aa  712  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
880 aa  673  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
880 aa  636  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
880 aa  675  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  64.53 
 
 
889 aa  1078  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
875 aa  645  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 
890 aa  954  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
897 aa  834  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
867 aa  637  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
885 aa  851  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 
897 aa  870  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
880 aa  637  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  51.56 
 
 
894 aa  829  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  64.3 
 
 
890 aa  1036  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 
895 aa  854  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
879 aa  648  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
879 aa  659  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
878 aa  655  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
864 aa  675  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
880 aa  636  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
886 aa  665  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
888 aa  960  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 
889 aa  1034  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
890 aa  912  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
874 aa  644  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
884 aa  639  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 
881 aa  917  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
903 aa  915  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
877 aa  641  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
896 aa  832  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
883 aa  706  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  53 
 
 
893 aa  840  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
876 aa  662  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
879 aa  664  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
902 aa  886  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
882 aa  669  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 
895 aa  902  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
889 aa  642  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0367295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>