More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2780 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 219 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  77.52 
 
 		 215 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  63.59 
 
 		 215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.57 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.14 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.8 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.25 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 223 aa  227  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  58.53 
 
 		 213 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  53.67 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.66 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.67 
 
 		 218 aa  221  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.02 
 
 		 236 aa  221  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.72 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.91 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.42 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2391  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.07 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0696687  hitchhiker  0.00128542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  53.46 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.76 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.45 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.59 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  52.04 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.9 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.68 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  55.3 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.09 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.05 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 223 aa  205  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  56.42 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.21 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  54.84 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.49 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.13 
 
 		 234 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.21 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6094  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.54 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634688  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  55.5 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0395  two component LuxR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.51 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.57 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.68 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  49.55 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.13 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5719  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.47 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.79 
 
 		 230 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.56 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  50.93 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  51.38 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  53.02 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.58 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.92 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.28 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.22 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  50.22 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.6 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  51.6 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 228 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.32 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  45.38 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1986  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  48.85 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.27 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.35 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.4 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  48.64 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.1 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  47.49 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>