219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4047 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  100 
 
 
516 aa  1024    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  63.92 
 
 
512 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.39 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  32.56 
 
 
567 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  31.08 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  33.24 
 
 
426 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  29.72 
 
 
530 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  32.31 
 
 
508 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.6 
 
 
580 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  32.11 
 
 
535 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  31.11 
 
 
551 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  43.03 
 
 
748 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  31.97 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  32.44 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  32.34 
 
 
567 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  33.15 
 
 
443 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  38.1 
 
 
628 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  41.61 
 
 
603 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  28.96 
 
 
620 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  33.24 
 
 
443 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  33.02 
 
 
310 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.46 
 
 
580 aa  100  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  28.25 
 
 
566 aa  100  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  35.08 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  37.14 
 
 
605 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  29.35 
 
 
602 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  37.28 
 
 
714 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  30.39 
 
 
568 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  42.31 
 
 
584 aa  97.4  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  39.13 
 
 
558 aa  96.7  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  27.12 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  30.84 
 
 
511 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  30.84 
 
 
488 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  27.75 
 
 
507 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  34.53 
 
 
413 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  41.6 
 
 
553 aa  90.5  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  25.57 
 
 
585 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  37.44 
 
 
637 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  36.36 
 
 
469 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  28.7 
 
 
498 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  33.43 
 
 
480 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  34.39 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  33.43 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  30.73 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  33.43 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  38.93 
 
 
620 aa  83.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  25.4 
 
 
434 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  27.99 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  27.99 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  32.79 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  27.9 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  26.54 
 
 
566 aa  80.1  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  28.92 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  29.03 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  27.65 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  28.37 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  28.2 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  28.89 
 
 
475 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  28.75 
 
 
464 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  28.37 
 
 
526 aa  77  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  26.67 
 
 
546 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  34.48 
 
 
222 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  27.97 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  28.05 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  37.88 
 
 
521 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  27.97 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  34.64 
 
 
709 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  28.41 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  27.97 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  28.79 
 
 
519 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  39.84 
 
 
169 aa  74.7  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  27.49 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  28.16 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  34.34 
 
 
561 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  28.16 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  27.58 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  40.32 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  27.56 
 
 
506 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  27.22 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  34.64 
 
 
743 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  27.22 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  26.59 
 
 
494 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  31.84 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  27.71 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  28.31 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  28.83 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  28.17 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  27.96 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  28 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  33.56 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  37.8 
 
 
578 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  37.8 
 
 
578 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  39.23 
 
 
524 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  30.06 
 
 
457 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  45.36 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  45.36 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  28.48 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  45.36 
 
 
578 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  28.79 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  30.92 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>