More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2306 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  100 
 
 		 296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  54.64 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 287 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  42.61 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  41.52 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  40.66 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  37.23 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  39.74 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  39.74 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  39.74 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  39.74 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  39.32 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  36.28 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  40.59 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  40.58 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  38 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  40.87 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  41.06 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  26.62 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  33.33 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  34.6 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  25.11 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  31.02 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  31.12 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  26.92 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  24.67 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  32.57 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  34.31 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  28.87 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  30.37 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  31.29 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  33.33 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.67 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  31.14 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  25.95 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  28.87 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  25 
 
 		 268 aa  116  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  29.95 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  29.25 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  29.09 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  33.18 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  26.6 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.05 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  28.64 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  27.36 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  22.95 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  34.38 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  29.22 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  30.23 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  25.11 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  34.51 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  30 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  34.36 
 
 		 389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  25.56 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  25.56 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  30.41 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  22.22 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  25.93 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  31.5 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  33.18 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  35.78 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  27.36 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  31.05 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  31.21 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 321 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  28.77 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  34.65 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  23.51 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  34.95 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  26.58 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0826  ABC transporter related protein  31.78 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.422704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  30.52 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  23.22 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  28.44 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  31.6 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  37.44 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  34.43 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  31.98 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  26.46 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0992  ABC transporter related  36.45 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  37.5 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  28.26 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.95 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  22.68 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  38.24 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  32.88 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>