232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1657 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 432 aa  842    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  74 
 
 		 437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.2 
 
 		 450 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  65.97 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  65.97 
 
 		 450 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  63.62 
 
 		 434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  67.84 
 
 		 462 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  66.28 
 
 		 461 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.08 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  68.38 
 
 		 442 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.73 
 
 		 447 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  63.79 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  60.66 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.67 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  66.74 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  58.85 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.29 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  60.48 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.89 
 
 		 449 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  59.81 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  61.29 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.18 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  53.69 
 
 		 414 aa  362  8e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  51.69 
 
 		 422 aa  360  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  49.75 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  50.85 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  49.62 
 
 		 408 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  52.62 
 
 		 539 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  56.05 
 
 		 431 aa  312  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  47.15 
 
 		 402 aa  302  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  48.07 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  49.16 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 390 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  49.74 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  48.48 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.59 
 
 		 404 aa  270  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.57 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.62 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  51.03 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  43.62 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  36.91 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  40.05 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.6 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.63 
 
 		 389 aa  249  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  41.67 
 
 		 876 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.51 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  38.76 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  42.03 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.75 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.44 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.92 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.48 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.53 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39.55 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  45.01 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.48 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.48 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.48 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.37 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.37 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.26 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.99 
 
 		 391 aa  243  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  38.37 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.31 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.64 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.64 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.64 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.64 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.26 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.64 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  40.61 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  42.12 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  38.97 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.8 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.85 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.25 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  41.62 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  41.58 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  43.99 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.48 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.69 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  35 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.96 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  37.79 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.96 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.85 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  39.75 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>