153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2365 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  100 
 
 		 349 aa  711    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  57.59 
 
 		 385 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  38.69 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  38.36 
 
 		 348 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.89 
 
 		 359 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  37.62 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  34.95 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  36.49 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  38.21 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  34.95 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  31.99 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.57 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  34.39 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  35.23 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  32.45 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.89 
 
 		 388 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.44 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  33.12 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  33.22 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.73 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  30.79 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  30.77 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  33.88 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  32.22 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  30.77 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  33.88 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  30.77 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  33.88 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  30.79 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  33.88 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  33.88 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  33.88 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  33.44 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  30.43 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  32.13 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  31.46 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  31.46 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  32.65 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  31.13 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  30.22 
 
 		 356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  32.25 
 
 		 352 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  29.26 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  29.26 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  29.26 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  29.28 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  29.28 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  27.83 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  28.75 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  28.91 
 
 		 492 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  29.1 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  28.65 
 
 		 481 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  28.61 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  28.61 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  28.61 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  29.45 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.51 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  29.39 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  29.52 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  29.78 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  29.37 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  29.39 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  26.89 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.05 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  28.48 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  26.5 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  28.16 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  28.16 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  28.24 
 
 		 366 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  24.5 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  28.99 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  25.48 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  27.74 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.02 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  25.48 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.02 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.02 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  27.33 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  29.36 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  26.74 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  25.48 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  27.75 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  29.04 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  29.29 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  27.03 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.88 
 
 		 364 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  28.66 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  28.66 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  36.62 
 
 		 456 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  30.4 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  26.89 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  25.8 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  25.8 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  30.09 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  26.56 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  27.25 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  29.13 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  22.9 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  22.53 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>