More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1138 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  48.6 
 
 		 1169 aa  1078    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  47.37 
 
 		 1199 aa  1014    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  43.17 
 
 		 1149 aa  826    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  78.28 
 
 		 1223 aa  1972    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.61 
 
 		 1132 aa  783    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  40.03 
 
 		 1189 aa  821    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  46.51 
 
 		 1183 aa  1043    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  39.88 
 
 		 1132 aa  786    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.8 
 
 		 1132 aa  777    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.88 
 
 		 1133 aa  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.88 
 
 		 1133 aa  779    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  41.68 
 
 		 1169 aa  819    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  50.25 
 
 		 1158 aa  1120    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  44.35 
 
 		 1182 aa  1006    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  45.78 
 
 		 1191 aa  1031    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  46.95 
 
 		 1178 aa  1029    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  49.34 
 
 		 1195 aa  1049    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  43.01 
 
 		 1150 aa  831    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  49.79 
 
 		 1157 aa  1106    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  47.78 
 
 		 1192 aa  1052    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  48.09 
 
 		 1193 aa  1032    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  47.88 
 
 		 1168 aa  1050    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  46.6 
 
 		 1208 aa  1025    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  47.51 
 
 		 1208 aa  1050    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.05 
 
 		 1132 aa  800    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  40.9 
 
 		 1254 aa  851    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.8 
 
 		 1132 aa  777    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  42.51 
 
 		 1163 aa  954    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  44.15 
 
 		 1188 aa  1014    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  48.54 
 
 		 1190 aa  1053    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  46.72 
 
 		 1182 aa  1008    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  47.66 
 
 		 1176 aa  1045    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  42.94 
 
 		 1156 aa  945    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  43.55 
 
 		 1150 aa  861    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.88 
 
 		 1132 aa  778    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  49.29 
 
 		 1171 aa  1070    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  40.16 
 
 		 1180 aa  852    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  44.1 
 
 		 1182 aa  996    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  44.33 
 
 		 1191 aa  984    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  49.17 
 
 		 1154 aa  1113    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  48.28 
 
 		 1151 aa  1005    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.61 
 
 		 1132 aa  783    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  47.71 
 
 		 1171 aa  1042    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  41.29 
 
 		 1208 aa  856    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  48.56 
 
 		 1184 aa  1060    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  46.78 
 
 		 1181 aa  1006    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  39.56 
 
 		 1136 aa  766    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  100 
 
 		 1215 aa  2491    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  43.71 
 
 		 1187 aa  1009    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  48.38 
 
 		 1167 aa  1066    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  45.48 
 
 		 1197 aa  1005    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  46.35 
 
 		 1224 aa  1041    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  41.28 
 
 		 1136 aa  787    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  50.58 
 
 		 1154 aa  1137    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  46.61 
 
 		 1173 aa  1016    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  39.53 
 
 		 1132 aa  778    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  48.1 
 
 		 1178 aa  1061    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  45.88 
 
 		 1216 aa  984    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  46.94 
 
 		 1176 aa  1044    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  44.07 
 
 		 1188 aa  1002    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  40.03 
 
 		 1132 aa  789    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  43.01 
 
 		 1150 aa  830    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  48.71 
 
 		 1158 aa  1058    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  45.83 
 
 		 1214 aa  986    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  48.46 
 
 		 1156 aa  1065    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  46.37 
 
 		 1212 aa  1046    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  42.27 
 
 		 1196 aa  859    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  45.13 
 
 		 1214 aa  1000    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  45.61 
 
 		 1191 aa  1032    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  43.95 
 
 		 1188 aa  1005    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  32.03 
 
 		 1266 aa  571  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  33.06 
 
 		 1278 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  32.17 
 
 		 1233 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  31.06 
 
 		 1274 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  32.93 
 
 		 1234 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  32.56 
 
 		 1236 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  31.58 
 
 		 1261 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  32.93 
 
 		 1234 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  32.35 
 
 		 1235 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  32.5 
 
 		 1245 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.11 
 
 		 1239 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  32.39 
 
 		 1230 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  32.39 
 
 		 1230 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  32.67 
 
 		 1250 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  31.8 
 
 		 1227 aa  552  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  32.36 
 
 		 1227 aa  552  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  32.26 
 
 		 1231 aa  553  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  31.49 
 
 		 1227 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  32.11 
 
 		 1227 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  31.36 
 
 		 1236 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  33.01 
 
 		 1232 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  32.82 
 
 		 1247 aa  552  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  32.96 
 
 		 1236 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  32.17 
 
 		 1237 aa  548  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  32 
 
 		 1239 aa  549  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  32.08 
 
 		 1235 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  32.34 
 
 		 1250 aa  549  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  31.51 
 
 		 1252 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  32.02 
 
 		 1241 aa  547  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  32.14 
 
 		 1227 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>