212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4828 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  100 
 
 
249 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  93.95 
 
 
250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  92.34 
 
 
250 aa  441  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  69.26 
 
 
250 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  70.66 
 
 
250 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  67.93 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  61.76 
 
 
255 aa  257  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  53.94 
 
 
256 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  56.25 
 
 
244 aa  232  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  59.92 
 
 
266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  52.05 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  45.06 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  52.5 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  50 
 
 
251 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  50.4 
 
 
257 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  55.42 
 
 
264 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  51.38 
 
 
247 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  54.92 
 
 
247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  52.92 
 
 
246 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  53.09 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  49.8 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  53.33 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  55.83 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  50 
 
 
247 aa  211  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  53.28 
 
 
264 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  51.41 
 
 
267 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  46.96 
 
 
270 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  47.56 
 
 
250 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  53.75 
 
 
251 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  51.43 
 
 
252 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  49.8 
 
 
253 aa  208  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  52.07 
 
 
267 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  49.59 
 
 
257 aa  207  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  51.48 
 
 
367 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  52.07 
 
 
246 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  52.03 
 
 
266 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  50.61 
 
 
272 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  48.78 
 
 
253 aa  204  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  44.62 
 
 
279 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  45.02 
 
 
279 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  45.02 
 
 
279 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  45.02 
 
 
279 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  45.02 
 
 
279 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  50.84 
 
 
252 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  45.02 
 
 
279 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  53.75 
 
 
246 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  50.64 
 
 
240 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  45.02 
 
 
279 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  45.02 
 
 
279 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  51.24 
 
 
248 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  44.62 
 
 
279 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  44.62 
 
 
279 aa  201  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  44.36 
 
 
278 aa  200  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  52.5 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  48.52 
 
 
279 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  50.63 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  50.4 
 
 
249 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  47.56 
 
 
251 aa  197  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  51.04 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  44.81 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  45.68 
 
 
288 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  43.83 
 
 
271 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  44.31 
 
 
270 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  45.6 
 
 
282 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  43.08 
 
 
271 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  43.08 
 
 
271 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  45.23 
 
 
276 aa  195  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  48.78 
 
 
253 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  43.97 
 
 
277 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  43.43 
 
 
279 aa  195  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  49.17 
 
 
267 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  43.21 
 
 
264 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  43.21 
 
 
264 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  48.16 
 
 
263 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  51.04 
 
 
248 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  47.3 
 
 
269 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  55.91 
 
 
227 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  42.04 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  42.04 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  49.17 
 
 
272 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  44.96 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  41.63 
 
 
269 aa  188  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  47.74 
 
 
246 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  48.15 
 
 
270 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  43.44 
 
 
266 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  44.13 
 
 
273 aa  185  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  46.56 
 
 
266 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  46.69 
 
 
267 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  48.35 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  44.4 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  41.15 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  47.72 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  45.27 
 
 
270 aa  182  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  39.52 
 
 
268 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  42.98 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  44.21 
 
 
270 aa  181  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  42.8 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  50.42 
 
 
260 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  43.57 
 
 
250 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  45.8 
 
 
272 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>