More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1041 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  100 
 
 
451 aa  897  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  63.29 
 
 
443 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  56.35 
 
 
450 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.9 
 
 
453 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  53.91 
 
 
512 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.63 
 
 
442 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  55.88 
 
 
469 aa  425  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  56.68 
 
 
405 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  56.01 
 
 
491 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  54.83 
 
 
447 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  50.95 
 
 
446 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  44.79 
 
 
493 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.27 
 
 
497 aa  315  1e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  43.55 
 
 
437 aa  304  2e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.82 
 
 
441 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  44.08 
 
 
484 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  45.39 
 
 
434 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  44.58 
 
 
478 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.94 
 
 
488 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.78 
 
 
468 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.09 
 
 
480 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.36 
 
 
489 aa  243  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.27 
 
 
455 aa  216  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  35.31 
 
 
440 aa  215  2e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.23 
 
 
442 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.26 
 
 
450 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.6 
 
 
484 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.59 
 
 
452 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.59 
 
 
442 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.99 
 
 
453 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.92 
 
 
461 aa  202  1e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.68 
 
 
477 aa  198  1e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.52 
 
 
477 aa  197  4e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.48 
 
 
446 aa  196  5e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.82 
 
 
479 aa  196  5e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.52 
 
 
477 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.06 
 
 
480 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  33.41 
 
 
434 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.35514e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  34.03 
 
 
454 aa  195  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.19 
 
 
539 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  34.04 
 
 
479 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  33.88 
 
 
442 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.01167e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.17 
 
 
478 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.42 
 
 
436 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.14483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  32.87 
 
 
435 aa  191  3e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  4.56355e-08  hitchhiker  5.11139e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  32.87 
 
 
435 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  5.55232e-06  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  32.87 
 
 
435 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.09945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.51 
 
 
449 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  32.87 
 
 
435 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.45313e-06  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  35.75 
 
 
462 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.44286e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.88 
 
 
445 aa  189  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  34.68 
 
 
449 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.74 
 
 
452 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.41 
 
 
455 aa  187  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  33.72 
 
 
445 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  33.64 
 
 
448 aa  186  1e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.76987e-07  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.43 
 
 
452 aa  186  1e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  32.51 
 
 
452 aa  185  2e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.7 
 
 
477 aa  185  2e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  32.85 
 
 
444 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.65 
 
 
494 aa  183  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  32.41 
 
 
435 aa  182  8e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  32.85 
 
 
438 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.58125e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.1 
 
 
616 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.09 
 
 
489 aa  181  3e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  33.84 
 
 
616 aa  181  3e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  32.3 
 
 
431 aa  180  5e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.17 
 
 
449 aa  179  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  32.18 
 
 
443 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  6.11538e-05  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  34.76 
 
 
481 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  32.79 
 
 
432 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.29322e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  31.41 
 
 
441 aa  175  1e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  9.83275e-07  unclonable  1.04798e-10 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  34.49 
 
 
482 aa  176  1e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  29.98 
 
 
464 aa  174  4e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  29.98 
 
 
464 aa  174  4e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  32.54 
 
 
435 aa  174  4e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.13836e-08  hitchhiker  8.82186e-11 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  36.59 
 
 
443 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  32.3 
 
 
435 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.08694e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  32.3 
 
 
435 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  6.21601e-07  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  32.3 
 
 
435 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.84345e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  30.21 
 
 
465 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.79 
 
 
465 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  29.65 
 
 
470 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.88 
 
 
456 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  35.36 
 
 
460 aa  167  3e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  29.93 
 
 
469 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  28.99 
 
 
489 aa  166  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  28.8 
 
 
493 aa  165  1e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  28.8 
 
 
493 aa  165  1e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  28.8 
 
 
493 aa  165  1e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.8 
 
 
493 aa  165  1e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.86 
 
 
449 aa  166  1e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.46 
 
 
498 aa  165  2e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.52 
 
 
456 aa  164  2e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  28.8 
 
 
495 aa  165  2e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  28.8 
 
 
495 aa  165  2e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  28.76 
 
 
489 aa  164  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  30.56 
 
 
455 aa  165  2e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3453  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.26 
 
 
432 aa  165  2e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  28.76 
 
 
489 aa  164  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>