More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0078 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 433 aa  870    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  58.26 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  51.15 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  52.92 
 
 		 349 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  52.92 
 
 		 349 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  53.94 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  49.27 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  48.98 
 
 		 349 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  52.11 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  48.26 
 
 		 375 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  47.32 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  48.97 
 
 		 346 aa  326  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  42.86 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  48.01 
 
 		 346 aa  319  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  49.85 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  48.58 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  45.77 
 
 		 341 aa  316  7e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  45.77 
 
 		 341 aa  316  7e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  47.02 
 
 		 347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  45.72 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  46 
 
 		 359 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  46.31 
 
 		 343 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  48.1 
 
 		 345 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  47.43 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  46.36 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  46.11 
 
 		 354 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  45.07 
 
 		 357 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  46.43 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  46.75 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  43.58 
 
 		 394 aa  292  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  47.2 
 
 		 382 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  48.33 
 
 		 347 aa  282  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  44.61 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  44.84 
 
 		 375 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  46.33 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  43.53 
 
 		 383 aa  274  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  43.07 
 
 		 342 aa  274  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  47.79 
 
 		 386 aa  273  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  46.24 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  46.59 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  45.34 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  45.95 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  42.69 
 
 		 384 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  41.1 
 
 		 362 aa  263  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  42.98 
 
 		 340 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  41.91 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  42.2 
 
 		 344 aa  249  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  41.91 
 
 		 351 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  41.5 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  37.86 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  40.86 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  37.42 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  37.72 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  37.06 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  31.25 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  31.91 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  33.13 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  31.64 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  32.13 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  28.65 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  33.44 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  26.2 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  27.67 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  26.46 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  31.13 
 
 		 334 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  31.46 
 
 		 387 aa  96.3  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  30.2 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29 
 
 		 763 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  28.67 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  27.5 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  28.99 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 765 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.52 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  29.61 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  27.53 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.11 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  26.74 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  28.52 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  30.23 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  26.71 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  26.74 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.21 
 
 		 777 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  29.51 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.66 
 
 		 757 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  26.32 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.3 
 
 		 757 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  28.32 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  26.29 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  28.52 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.94 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.94 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.94 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.94 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  28.43 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.94 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.83 
 
 		 757 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  28.36 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  28.36 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.08 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  24.57 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>