More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1132 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  63.57 
 
 		 295 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  60.24 
 
 		 280 aa  322  6e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  60.47 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  55.68 
 
 		 273 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  54.78 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  55.77 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  55.73 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  54.48 
 
 		 288 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.28 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  52.67 
 
 		 269 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  51.46 
 
 		 258 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  51.88 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.81 
 
 		 254 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.6 
 
 		 254 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50.59 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.64 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  51.48 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.72 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 		 253 aa  255  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  56.59 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.24 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50.21 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  53.04 
 
 		 253 aa  252  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  50 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.3 
 
 		 274 aa  251  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.21 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.95 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  50 
 
 		 279 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.91 
 
 		 252 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.21 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  50 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 258 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  55.5 
 
 		 261 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.31 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 		 261 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 272 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48.93 
 
 		 267 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 260 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  49.14 
 
 		 257 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  51.05 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  46.61 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.46 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 264 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  48.33 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  50 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  45.38 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0767  ABC transporter related  44.94 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  43.9 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  48.29 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.16 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.55 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  49.55 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.8 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  44.3 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  46.34 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  49.36 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  53.55 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  48.31 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  43.7 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  47.48 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.26 
 
 		 279 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.5 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.78 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.43 
 
 		 264 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  54.46 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  43.08 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  42.86 
 
 		 284 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  47.52 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  51.92 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.22 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.21 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.8 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.08 
 
 		 272 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.38 
 
 		 260 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  52.43 
 
 		 287 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.32 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.71 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  50.71 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  50.71 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  45.35 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  47.48 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>