More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0402 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.15 
 
 
543 aa  751    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.87 
 
 
542 aa  784    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.87 
 
 
540 aa  718    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.07 
 
 
542 aa  688    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
562 aa  1151    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  48.8 
 
 
539 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.8 
 
 
539 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.59 
 
 
539 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.93 
 
 
546 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  45.56 
 
 
552 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.7 
 
 
589 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  42.94 
 
 
576 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.96 
 
 
608 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.54 
 
 
627 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.55 
 
 
644 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  40.93 
 
 
584 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.64 
 
 
638 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.92 
 
 
570 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  41.76 
 
 
609 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.28 
 
 
648 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.28 
 
 
648 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.86 
 
 
623 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.47 
 
 
648 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  42.96 
 
 
626 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  42.96 
 
 
598 aa  345  8.999999999999999e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  40.19 
 
 
582 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  40.72 
 
 
646 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  40.26 
 
 
574 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.93 
 
 
646 aa  340  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  39.59 
 
 
568 aa  339  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.02 
 
 
644 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.38 
 
 
646 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.44 
 
 
643 aa  330  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  40.98 
 
 
633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41 
 
 
637 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.66 
 
 
598 aa  326  5e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  41.79 
 
 
630 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.82 
 
 
637 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  38.63 
 
 
576 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.81 
 
 
621 aa  323  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  38.54 
 
 
641 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  38.68 
 
 
598 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.82 
 
 
681 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  39.23 
 
 
575 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.59 
 
 
680 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  35.98 
 
 
591 aa  306  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.05 
 
 
568 aa  306  7e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.45 
 
 
566 aa  303  5.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.93 
 
 
578 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.8 
 
 
575 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.78 
 
 
579 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.4 
 
 
575 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.4 
 
 
575 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.8 
 
 
575 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.24 
 
 
605 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.08 
 
 
567 aa  293  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.13 
 
 
579 aa  293  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.94 
 
 
605 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.58 
 
 
567 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  35.49 
 
 
596 aa  292  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.52 
 
 
599 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.76 
 
 
605 aa  291  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39 
 
 
542 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.4 
 
 
575 aa  290  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.51 
 
 
567 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.09 
 
 
567 aa  289  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  38.3 
 
 
515 aa  288  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  37.52 
 
 
572 aa  286  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  34.81 
 
 
542 aa  287  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  39.04 
 
 
522 aa  287  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1990  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.33 
 
 
609 aa  286  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.902859  normal  0.104925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.53 
 
 
606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3969  L-aspartate oxidase  34.45 
 
 
585 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.72 
 
 
602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.58 
 
 
605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  35.53 
 
 
567 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.57 
 
 
617 aa  283  8.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  35.96 
 
 
594 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  37.91 
 
 
515 aa  282  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.4 
 
 
612 aa  281  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.864322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.62 
 
 
612 aa  280  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.93 
 
 
566 aa  280  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.4 
 
 
612 aa  280  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.92 
 
 
592 aa  280  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.56 
 
 
590 aa  280  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.5 
 
 
566 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  36.36 
 
 
533 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.65 
 
 
597 aa  276  7e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  35.09 
 
 
532 aa  276  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.2 
 
 
598 aa  276  8e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.55 
 
 
611 aa  276  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.83 
 
 
582 aa  276  9e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.07 
 
 
587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 
545 aa  276  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.69 
 
 
592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.9 
 
 
598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.69 
 
 
592 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.69 
 
 
592 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.69 
 
 
592 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  36.07 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.207594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>