More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0335 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2308  hydrogenase accessory protein HypB  78.5 
 
 		 215 aa  350  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  77.57 
 
 		 215 aa  347  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  72.56 
 
 		 215 aa  334  5e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1515  hypothetical protein  62.62 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0055  hydrogenase accessory protein HypB  49.07 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1150  hydrogenase accessory protein HypB  49.07 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.922491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0768  hydrogenase accessory protein HypB  49.54 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1020  hydrogenase accessory protein HypB  46.76 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0833  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  46.01 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2335  hydrogenase accessory protein HypB  53.47 
 
 		 297 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  43.75 
 
 		 294 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  44.71 
 
 		 289 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  44.12 
 
 		 286 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  43.75 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  44.23 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  42.38 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  46 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  42.5 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  41.83 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  42.31 
 
 		 292 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  45.1 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  40.82 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  44.6 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  42.44 
 
 		 312 aa  161  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  41.83 
 
 		 269 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  43.33 
 
 		 321 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  39.6 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  41.43 
 
 		 326 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  39.02 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  45.1 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  37.14 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.27 
 
 		 303 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  41.75 
 
 		 275 aa  158  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  42.31 
 
 		 322 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  37.21 
 
 		 281 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 352 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  43.14 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  39.51 
 
 		 270 aa  156  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  36.74 
 
 		 284 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2548  hydrogenase accessory protein HypB  41.18 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0731217  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  39.05 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  41.35 
 
 		 273 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  44.23 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  44.23 
 
 		 266 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  41.83 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  43.9 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  41.35 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  37.14 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  40.87 
 
 		 306 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  36.74 
 
 		 280 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  42.25 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  38.79 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  41.43 
 
 		 307 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  40.98 
 
 		 269 aa  151  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  36.71 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  43.72 
 
 		 283 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  45.05 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  37.38 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 303 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  42.5 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  42.86 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  40.64 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.97 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  40.5 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  40.65 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  45.27 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  39.02 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3017  hydrogenase accessory protein HypB  37.56 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  38 
 
 		 283 aa  148  8e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  35.24 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  38.54 
 
 		 288 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  36.57 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.97 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  42.38 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.95 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  38.35 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  35.24 
 
 		 271 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  42.44 
 
 		 407 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  36.19 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  41.46 
 
 		 394 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  39.35 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  36.06 
 
 		 262 aa  145  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  35.55 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  38.29 
 
 		 328 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  43.08 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  38.05 
 
 		 290 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  38.05 
 
 		 290 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  144  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.05 
 
 		 290 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>