More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3751 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.5 
 
 
234 aa  359  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.6 
 
 
235 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  64.1 
 
 
234 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
234 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  54.94 
 
 
259 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  51.71 
 
 
234 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.28 
 
 
234 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  56.6 
 
 
242 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  56.84 
 
 
233 aa  260  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  52.56 
 
 
234 aa  260  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  53.42 
 
 
239 aa  259  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 
233 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  52.99 
 
 
239 aa  256  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  52.36 
 
 
234 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  52.56 
 
 
234 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  53.42 
 
 
237 aa  254  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  52.79 
 
 
233 aa  254  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.77 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  54.51 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  54.42 
 
 
234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.28 
 
 
236 aa  252  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  54.27 
 
 
234 aa  252  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.56 
 
 
237 aa  251  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.22 
 
 
233 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  53.22 
 
 
236 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  52.79 
 
 
233 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  52.36 
 
 
233 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.36 
 
 
233 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  53.22 
 
 
233 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  52.36 
 
 
233 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
236 aa  249  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.79 
 
 
254 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  52.36 
 
 
233 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  52.36 
 
 
233 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  50.64 
 
 
236 aa  249  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  52.79 
 
 
254 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  53.42 
 
 
238 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  49.15 
 
 
244 aa  249  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.5 
 
 
237 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.5 
 
 
237 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  52.79 
 
 
233 aa  248  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.5 
 
 
237 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.5 
 
 
237 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.5 
 
 
237 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1138  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.113733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  51.93 
 
 
233 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  52.36 
 
 
254 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  51.93 
 
 
254 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
235 aa  248  7e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  52.79 
 
 
234 aa  248  7e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  51.07 
 
 
235 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  53.42 
 
 
234 aa  247  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 
234 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  52.36 
 
 
254 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.64 
 
 
237 aa  245  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  54.27 
 
 
240 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  53.22 
 
 
245 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.79 
 
 
236 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  51.28 
 
 
236 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.79 
 
 
236 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  51.28 
 
 
234 aa  245  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  51.07 
 
 
235 aa  244  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  51.07 
 
 
237 aa  244  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  51.07 
 
 
234 aa  244  6.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  48.5 
 
 
237 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  51.5 
 
 
233 aa  244  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.93 
 
 
236 aa  244  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  53.22 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.93 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  52.36 
 
 
238 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  54.04 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.07 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  50.21 
 
 
237 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
237 aa  241  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 
237 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 
237 aa  241  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 
233 aa  241  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  50.21 
 
 
237 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.64 
 
 
233 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.5 
 
 
238 aa  241  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
256 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.46 
 
 
247 aa  239  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.79 
 
 
237 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.79 
 
 
241 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.36 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  49.79 
 
 
234 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  51.07 
 
 
258 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  51.34 
 
 
237 aa  238  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.5 
 
 
233 aa  238  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.5 
 
 
233 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.5 
 
 
233 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  51.07 
 
 
234 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
234 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.07 
 
 
237 aa  238  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>