73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2376 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  400  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  43.33 
 
 
302 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  41.67 
 
 
212 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  41.67 
 
 
300 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  44.77 
 
 
238 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  42.27 
 
 
218 aa  141  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  41.11 
 
 
232 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  41.14 
 
 
246 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  41.86 
 
 
238 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  43.1 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  40.11 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  39.13 
 
 
238 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  38.01 
 
 
202 aa  124  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  38.24 
 
 
300 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  38.67 
 
 
241 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  38.25 
 
 
207 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  40.12 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  37.99 
 
 
208 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  36.72 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  41.22 
 
 
240 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  37.57 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  41.77 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  34.38 
 
 
234 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  33.89 
 
 
283 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  34.59 
 
 
245 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  31.35 
 
 
245 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  32.74 
 
 
234 aa  92  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  33.53 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  28.95 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  28.02 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  32.65 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  33.12 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  31.29 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  27.87 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  29.45 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.19 
 
 
264 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  28.31 
 
 
262 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  38.71 
 
 
247 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  34.62 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.37 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.9 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.59 
 
 
282 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.6 
 
 
262 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  40.74 
 
 
262 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  27.61 
 
 
268 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  35.85 
 
 
252 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  26.03 
 
 
210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  26.03 
 
 
219 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  26.25 
 
 
261 aa  44.7  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  27.66 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  36.21 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  32.05 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  25.81 
 
 
262 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1957  protein of unknown function DUF218  26.88 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1984  protein of unknown function DUF218  26.88 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  27.41 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  29.55 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 
259 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  27.1 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  31.58 
 
 
228 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  28.75 
 
 
279 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  34.67 
 
 
280 aa  42  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  37.7 
 
 
267 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  42.86 
 
 
206 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  26.49 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  26.23 
 
 
235 aa  41.6  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  42.37 
 
 
301 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  27.7 
 
 
275 aa  41.2  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>