More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1789 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  72.84 
 
 		 236 aa  362  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  72.41 
 
 		 236 aa  361  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  72.41 
 
 		 236 aa  361  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  73.78 
 
 		 237 aa  359  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  72.44 
 
 		 243 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  72.44 
 
 		 243 aa  354  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  76.47 
 
 		 236 aa  351  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  71.95 
 
 		 235 aa  347  7e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  72.85 
 
 		 241 aa  346  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 239 aa  345  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  72 
 
 		 252 aa  344  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  68.64 
 
 		 236 aa  343  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  71.88 
 
 		 249 aa  343  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  69.74 
 
 		 232 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  70.18 
 
 		 236 aa  342  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  70.18 
 
 		 236 aa  342  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  68.94 
 
 		 235 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  69.3 
 
 		 232 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  69.3 
 
 		 232 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  71.95 
 
 		 252 aa  341  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  72.27 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  72.27 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  72.2 
 
 		 223 aa  340  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  71.82 
 
 		 248 aa  339  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  69.3 
 
 		 231 aa  338  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  72.48 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  70.32 
 
 		 231 aa  337  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  71.36 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  70.09 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  70.59 
 
 		 239 aa  335  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1846  30S ribosomal protein S3  72.43 
 
 		 226 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00843492  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  70.72 
 
 		 240 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  68.3 
 
 		 238 aa  331  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  69.47 
 
 		 225 aa  330  8e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  69.91 
 
 		 225 aa  329  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0591  30S ribosomal protein S3  68.07 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1255  30S ribosomal protein S3  64.07 
 
 		 231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.378037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1347  30S ribosomal protein S3  62.34 
 
 		 231 aa  311  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  67.79 
 
 		 211 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  66.35 
 
 		 211 aa  298  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  64.68 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  59.66 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  60.78 
 
 		 256 aa  293  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0059  ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 275 aa  293  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000192317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  61.04 
 
 		 244 aa  292  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  66.35 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 211 aa  292  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  66.03 
 
 		 210 aa  291  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 308 aa  291  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 210 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  60 
 
 		 227 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  59.32 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  60 
 
 		 227 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  63.98 
 
 		 210 aa  289  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0279  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 288 aa  288  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000626052  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  64.08 
 
 		 285 aa  288  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0284  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 288 aa  288  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128971  hitchhiker  0.0000000454249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  61.47 
 
 		 230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  61.71 
 
 		 230 aa  287  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0320  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 268 aa  287  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000941491  decreased coverage  0.00272793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3638  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 268 aa  287  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000231617  hitchhiker  0.0000000000213568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0344  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212701  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2834  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000988121  normal  0.306449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3013  30S ribosomal protein S3  63.11 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000335081  decreased coverage  0.002387 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3484  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00131963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2944  30S ribosomal protein S3  63.11 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012288  decreased coverage  0.000000133007 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2626  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0741143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  60.55 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3770  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000624926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3453  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000212964  decreased coverage  0.00445176 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3740  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0282  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000274054  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3798  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0333  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000255455  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2753  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000356119  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1930  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000560778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3163  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161585  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0273  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00291944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0354  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000020511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  60.61 
 
 		 234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3291  30S ribosomal protein S3  63.11 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000159884  hitchhiker  0.00000252184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3789  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 298 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.461405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  60.79 
 
 		 232 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1270  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 294 aa  285  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00251085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0255  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132359  normal  0.0208099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3062  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 266 aa  285  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000122398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  64.59 
 
 		 228 aa  284  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  64.59 
 
 		 220 aa  284  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  59.83 
 
 		 229 aa  284  7e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0397  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 290 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  60.27 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>