142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2849 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.68 
 
 
277 aa  363  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.04 
 
 
286 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  54.3 
 
 
292 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  54.88 
 
 
274 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.96 
 
 
290 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.25 
 
 
291 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  53.94 
 
 
286 aa  266  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.81 
 
 
271 aa  265  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.95 
 
 
284 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.95 
 
 
284 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.5 
 
 
292 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.56 
 
 
284 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  52.03 
 
 
291 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.97 
 
 
284 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  47.1 
 
 
282 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.02 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.37 
 
 
288 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.31 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.93 
 
 
256 aa  234  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.75 
 
 
245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  45.12 
 
 
256 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.63 
 
 
290 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.9 
 
 
286 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.92 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.04 
 
 
250 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.5 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 
837 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.43 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.6 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.52 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.56 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.38 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.23 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.41 
 
 
808 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.7 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.51 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.23 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 
266 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  25.36 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.93 
 
 
437 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.26 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.1 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  30 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.86 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.22 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.53 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.33 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.14 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.86 
 
 
639 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  26.85 
 
 
617 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.77 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.44 
 
 
591 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.65 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.77 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.52 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  29.13 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.21 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.52 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.52 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 
226 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.58 
 
 
460 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.44 
 
 
244 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  26.3 
 
 
673 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.14 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.93 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.19 
 
 
644 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>