More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0318 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  53.31 
 
 		 286 aa  296  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  44.25 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  48.03 
 
 		 274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  43.1 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  42.71 
 
 		 290 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  42.86 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  40.42 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  43.21 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  42.01 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  44.14 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  42.01 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  43.1 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  43.21 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  40.89 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  41.46 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  40.77 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  38.68 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  42.55 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  41.64 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  44.95 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  42.76 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  39.64 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  41.79 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  40.57 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  39.86 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  39.86 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  36.4 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  40.99 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  37.32 
 
 		 317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  39.86 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  36.46 
 
 		 326 aa  181  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  35.31 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  40.21 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  37.37 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  36.68 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  35.59 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  37.37 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  40.07 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  41.16 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  41.84 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  41.49 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  41.49 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  41.49 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  37.89 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  40.64 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  39.86 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  36.01 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  35.99 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  37.06 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  37.06 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  34.97 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  37.06 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  37.15 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  39.79 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  41.35 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  40.57 
 
 		 918 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  36.59 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  34.45 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  35.69 
 
 		 302 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.55 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  38.73 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  36.14 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  38.49 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  34.28 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  34.84 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  36.75 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  36.08 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  33.45 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  35.81 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  36.68 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  35.29 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  39.64 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  35.91 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  36.14 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  35.47 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  33.68 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  34.49 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  38.52 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  33.1 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  36.08 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  34.39 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  33.56 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  33.22 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32.99 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  35.54 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  32.39 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  32.39 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  34.24 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  35.69 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  33.12 
 
 		 314 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  36.71 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  34.27 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  34.46 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  32.75 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  30.72 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  35.4 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  35.4 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  35.4 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  35.09 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>