58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1587 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  551  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  53.16 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  39.42 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  36.47 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  38.46 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  34.12 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  36.07 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  32.92 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  33.06 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  34.8 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  32.64 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  30.89 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  29.2 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  31.5 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  30.33 
 
 		 245 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  32.81 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  27.91 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  26.07 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  28.74 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  26.75 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  24.48 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  28.69 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  31.01 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  25.82 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  29.76 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  25.58 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  29.2 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  32.55 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  28.57 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  26.72 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  28.31 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  29.36 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  27.16 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  28.14 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  27.9 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  31.94 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  28.88 
 
 		 388 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  27.59 
 
 		 388 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  28.87 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  25.94 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  30.28 
 
 		 384 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  30.19 
 
 		 328 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  27.53 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  27.59 
 
 		 421 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  23.98 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  23.11 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  23.74 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  30.19 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  25.68 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  23.6 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  22.35 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  28.09 
 
 		 384 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  23.44 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  41.43 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  25.11 
 
 		 382 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  24.51 
 
 		 401 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  25.45 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>