214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3420 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  100 
 
 
414 aa  785  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  77.66 
 
 
396 aa  554  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  67.85 
 
 
399 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  67.85 
 
 
399 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  67.85 
 
 
399 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  62.53 
 
 
387 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  57.32 
 
 
414 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  57.51 
 
 
400 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  55.83 
 
 
447 aa  359  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  59.17 
 
 
435 aa  356  4e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 
408 aa  345  9e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 
439 aa  265  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  52.33 
 
 
421 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  44.06 
 
 
403 aa  262  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  40 
 
 
428 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 
398 aa  236  5e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  35.2 
 
 
384 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  37.75 
 
 
437 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
385 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
387 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  30.9 
 
 
397 aa  153  6e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
402 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.26 
 
 
405 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.81 
 
 
397 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
383 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
396 aa  147  4e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.22 
 
 
396 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
397 aa  146  7e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.66 
 
 
386 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
388 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.25 
 
 
400 aa  139  9e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
369 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
386 aa  137  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
391 aa  136  7e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  30.67 
 
 
417 aa  136  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.42 
 
 
432 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.89474e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
390 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  33.33 
 
 
400 aa  129  7e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
378 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  31.32 
 
 
403 aa  127  4e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.47 
 
 
396 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
381 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
407 aa  122  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  30.9 
 
 
441 aa  122  1e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  32.02 
 
 
391 aa  121  2e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  34.05 
 
 
393 aa  122  2e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.25 
 
 
384 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  31.28 
 
 
408 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.59 
 
 
373 aa  119  1e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
387 aa  119  1e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.08 
 
 
398 aa  115  1e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
405 aa  114  4e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  28.3 
 
 
383 aa  111  2e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  29.35 
 
 
388 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 
409 aa  110  4e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  31.25 
 
 
403 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  29.95 
 
 
388 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
465 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
389 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  29.06 
 
 
443 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
464 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  31.88 
 
 
409 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  28.85 
 
 
383 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
403 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
373 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
446 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  29.49 
 
 
395 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
389 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  25.71 
 
 
392 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
425 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  32.62 
 
 
374 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  25.66 
 
 
383 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  26.18 
 
 
383 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  29.1 
 
 
396 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  31.98 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  7.15717e-05 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
394 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
384 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  28.77 
 
 
385 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  28.77 
 
 
385 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.08 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.05 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  30.08 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  31.71 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.46 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  27.46 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  27.46 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  27.46 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  27.46 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  27.46 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  27.46 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>