More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1549 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
512 aa  1028  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  70.36 
 
 
500 aa  712  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  64.97 
 
 
502 aa  665  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  1.44188e-05 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  81.62 
 
 
503 aa  801  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  71.6 
 
 
501 aa  699  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  70.36 
 
 
500 aa  712  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  56.73 
 
 
518 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  52.54 
 
 
526 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  52.73 
 
 
532 aa  471  1e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  3.65626e-06 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  53.2 
 
 
525 aa  471  1e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  49.71 
 
 
532 aa  468  1e-130  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  49.32 
 
 
539 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  53.63 
 
 
527 aa  454  1e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  53.63 
 
 
527 aa  454  1e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  53.63 
 
 
527 aa  454  1e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  47.94 
 
 
543 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  47.62 
 
 
522 aa  399  1e-110  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  45.03 
 
 
551 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  44.85 
 
 
554 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  44.02 
 
 
557 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  47.01 
 
 
549 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 
572 aa  241  3e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
708 aa  220  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 
613 aa  202  1e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.66 
 
 
534 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.66 
 
 
534 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.85 
 
 
608 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  5.71786e-05 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  36.75 
 
 
535 aa  185  2e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
525 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  31.97 
 
 
547 aa  180  5e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 
551 aa  176  1e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
520 aa  174  2e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.47 
 
 
597 aa  173  6e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  35.2 
 
 
550 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  33.24 
 
 
549 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
509 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.79 
 
 
538 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
512 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.8 
 
 
545 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
521 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.9 
 
 
600 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.68 
 
 
516 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 
593 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.77 
 
 
630 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.5 
 
 
596 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
506 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.63 
 
 
622 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
552 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.27 
 
 
605 aa  157  5e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.29 
 
 
592 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.29 
 
 
592 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 
512 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  29.39 
 
 
723 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.29 
 
 
592 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 
503 aa  156  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.43 
 
 
491 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
532 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.37 
 
 
537 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.9 
 
 
592 aa  154  3e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 
533 aa  153  6e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.07 
 
 
601 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
560 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.95 
 
 
609 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.77 
 
 
517 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.84 
 
 
512 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.4 
 
 
517 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.62 
 
 
509 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.4 
 
 
517 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.4 
 
 
517 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.77 
 
 
517 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
490 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 
662 aa  149  1e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 
807 aa  149  1e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 
553 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.77 
 
 
621 aa  147  4e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
492 aa  147  4e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.11 
 
 
514 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.76 
 
 
600 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
487 aa  146  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.25 
 
 
598 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 
608 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
603 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 
510 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
495 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 
542 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
505 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.94 
 
 
517 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 
498 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 
585 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  29.3 
 
 
538 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 
534 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
551 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 
546 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
552 aa  143  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 
552 aa  143  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 
504 aa  142  1e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 
506 aa  142  1e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 
536 aa  142  2e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
521 aa  142  2e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  28.8 
 
 
549 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>