55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0284 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  100 
 
 		 882 aa  1737    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  31.05 
 
 		 310 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  38.96 
 
 		 1783 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  30.36 
 
 		 2096 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5515  triple helix repeat-containing collagen  36.42 
 
 		 247 aa  91.3  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  normal  0.284565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  48.91 
 
 		 646 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 		 4231 aa  81.3  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  29.75 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.51 
 
 		 14944 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  31.18 
 
 		 910 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  25.53 
 
 		 652 aa  67  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.48 
 
 		 11716 aa  65.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  24.14 
 
 		 940 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28 
 
 		 12684 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  25.48 
 
 		 460 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  24.5 
 
 		 1334 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09933  hypothetical protein  21.72 
 
 		 349 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  28.71 
 
 		 1021 aa  55.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1344 aa  54.3  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0043  LVIVD repeat-containing protein  32.88 
 
 		 796 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  20.72 
 
 		 504 aa  53.9  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.45 
 
 		 354 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  37.68 
 
 		 1361 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25.95 
 
 		 491 aa  52.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  25.25 
 
 		 487 aa  52  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.7 
 
 		 493 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  31.34 
 
 		 656 aa  52  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  31.82 
 
 		 1279 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.6 
 
 		 752 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  37.88 
 
 		 525 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0082  LVIVD repeat protein  26.77 
 
 		 256 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1265 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  31.02 
 
 		 857 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 635 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1030 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3663  LVIVD repeat protein  24.28 
 
 		 385 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022114  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2088  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.96 
 
 		 323 aa  49.7  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  26.29 
 
 		 1432 aa  48.9  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  39.68 
 
 		 416 aa  48.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  27.21 
 
 		 14609 aa  48.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07181  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 		 452 aa  48.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882964  normal  0.428749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1767  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.66 
 
 		 433 aa  48.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  32.31 
 
 		 771 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  24.24 
 
 		 384 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  26.56 
 
 		 1532 aa  47  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1096 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  32.88 
 
 		 926 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  21.36 
 
 		 470 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1932  hypothetical protein  31.97 
 
 		 604 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.22 
 
 		 752 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  32.88 
 
 		 631 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1990  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.06 
 
 		 470 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  24.44 
 
 		 1675 aa  44.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  38 
 
 		 168 aa  44.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  20.54 
 
 		 472 aa  44.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>