13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0082 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0082  LVIVD repeat protein  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3663  LVIVD repeat protein  41.63 
 
 		 385 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022114  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5493  hypothetical protein  39.91 
 
 		 432 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.451646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00705  hypothetical protein  41.36 
 
 		 408 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.4 
 
 		 2096 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  23.97 
 
 		 645 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  26.77 
 
 		 882 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  26.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  25.3 
 
 		 4231 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  27.21 
 
 		 14609 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6446  hypothetical protein  22.97 
 
 		 403 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  21.99 
 
 		 11716 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.63 
 
 		 12684 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>