65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3077 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 251 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  56.92 
 
 		 254 aa  261  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  47.51 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  43.2 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  39.84 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.81 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  37.89 
 
 		 768 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.84 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  35.11 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  27.06 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  32.05 
 
 		 736 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  26 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  33.2 
 
 		 748 aa  92  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  25.79 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.98 
 
 		 767 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  27.24 
 
 		 977 aa  85.5  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  30.65 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  29.59 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  29.46 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  25.09 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.37 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  29.84 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  28.28 
 
 		 964 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  28.12 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  27.98 
 
 		 972 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  31.68 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  28.57 
 
 		 770 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  38.74 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  28.11 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  26.16 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  30.2 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  29.25 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  27.03 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  29 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  27.89 
 
 		 998 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  31.35 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  25.7 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.27 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  25.82 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  32.79 
 
 		 891 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  32.76 
 
 		 357 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  32.76 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  32.97 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  27.01 
 
 		 375 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 298 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>