More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03203 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  100 
 
 		 327 aa  679    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  74.32 
 
 		 298 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  55.74 
 
 		 297 aa  335  9e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1841  PfkB  42.41 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  39.93 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  39.47 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  43.88 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38.49 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.62 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.83 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1216  carbohydrate kinase ribokinase family protein  42.12 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  36.07 
 
 		 313 aa  176  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.67 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2877  ribokinase-like domain-containing protein  43.49 
 
 		 284 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  38.61 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  37.9 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  38.85 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  35.74 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  36.67 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  38.98 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  36.6 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  37.21 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35.57 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  36.07 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  36.75 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  35.23 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  37.25 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  35.41 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  34.68 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.53 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  34.56 
 
 		 340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  35.79 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  37.42 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  34.34 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  37.42 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  37.42 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  37.87 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  37.42 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  36.21 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.06 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  36.21 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  36.21 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  37.16 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  34.9 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  31.7 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  36.7 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  36.7 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  36.93 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  34.54 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  37.58 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  36.24 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  35.86 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  36.24 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  36.7 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  34.87 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  33.99 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  35.06 
 
 		 304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  35.06 
 
 		 304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.6 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  33.99 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  32.44 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.6 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  36.6 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.6 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  36.6 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  36.6 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  36.6 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  36.6 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  36.12 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  35.88 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  33.11 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  32.44 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  36.12 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  35 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  33.55 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  34.32 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  33.78 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  31.27 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  34.1 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  35.62 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  36.42 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  38.93 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  32.79 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  31.99 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  34.92 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  35.57 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  36.09 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  32.11 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  34.88 
 
 		 303 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  35.18 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  35.67 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  36 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  36.54 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  35 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  35.33 
 
 		 301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.33 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  34.81 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  34.23 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>