More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1384 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  100 
 
 		 373 aa  777    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  64.05 
 
 		 372 aa  501  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  59.95 
 
 		 372 aa  491  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  59.41 
 
 		 372 aa  479  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  57.22 
 
 		 376 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  54.05 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  40.7 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  39.78 
 
 		 374 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  38.54 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.98 
 
 		 377 aa  288  9e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  38.32 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  32.91 
 
 		 404 aa  206  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  32.16 
 
 		 368 aa  205  9e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  30.06 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  30.59 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  30.45 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  29.17 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  31.01 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  26.7 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  27.46 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  32.51 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.82 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.82 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  29.48 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.96 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  30.06 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  28.34 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  32 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  24.93 
 
 		 362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  31.49 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  26.82 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  26.25 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  26.55 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  30.69 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  27.86 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  27.35 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  26.05 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  29.59 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  27.06 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  28.1 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  28.4 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  28.13 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  28.22 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  26.47 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  26.73 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  27.35 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  25.2 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  26.02 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  26.45 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  28.9 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  28.69 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  27.07 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  25.74 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  25.44 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  29.75 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.6 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  27.75 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  28.24 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  27.93 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  28.48 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  27.86 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  26.54 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  27.35 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  29.41 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.67 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  27 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  26.61 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  27.52 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  27.35 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  28.08 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  28.16 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  28.98 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  26.11 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  27.98 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  26.65 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  26.67 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  25.96 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27.65 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  29.28 
 
 		 418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  26.74 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.08 
 
 		 545 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  26.52 
 
 		 407 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  26.74 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  25.8 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  25.66 
 
 		 393 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  28.48 
 
 		 408 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>