More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0356 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 536 aa  1080    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  73.12 
 
 		 491 aa  754    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  54.79 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  52.99 
 
 		 545 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  52.99 
 
 		 545 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  47.83 
 
 		 528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  47.46 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  47.78 
 
 		 555 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  47.04 
 
 		 544 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  46.85 
 
 		 576 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  48.44 
 
 		 517 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  46.96 
 
 		 543 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  47.24 
 
 		 530 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  47.52 
 
 		 530 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  46.59 
 
 		 533 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  46.97 
 
 		 543 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  46.78 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  46.78 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  46.78 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  46.59 
 
 		 533 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  46.59 
 
 		 533 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  46.59 
 
 		 533 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  46.59 
 
 		 533 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  45.54 
 
 		 532 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  46.71 
 
 		 532 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  46.17 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  45.4 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  44.91 
 
 		 516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  45.4 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  45.4 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  45.4 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  40.54 
 
 		 530 aa  392  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  32.47 
 
 		 529 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 		 546 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  33.77 
 
 		 543 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  33.46 
 
 		 541 aa  295  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  35.86 
 
 		 525 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  35.66 
 
 		 518 aa  289  9e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  33.83 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  32.72 
 
 		 537 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 537 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  32.16 
 
 		 664 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  32.35 
 
 		 541 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  32.16 
 
 		 666 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  33.52 
 
 		 522 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  32.15 
 
 		 541 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.44 
 
 		 560 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.44 
 
 		 560 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  32.24 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  32.5 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 541 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  32.5 
 
 		 541 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 541 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 541 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  32.31 
 
 		 541 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 		 546 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  30.51 
 
 		 519 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  30.51 
 
 		 642 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  31.4 
 
 		 531 aa  252  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  30.51 
 
 		 642 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  30.77 
 
 		 535 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  31.84 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  36.3 
 
 		 533 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  32.42 
 
 		 537 aa  243  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  32.09 
 
 		 521 aa  243  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 		 533 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  32.88 
 
 		 528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 		 539 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  29.87 
 
 		 539 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 616 aa  227  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 630 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  30.13 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  30.13 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  28.6 
 
 		 542 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 635 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  28.4 
 
 		 542 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 576 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  27.5 
 
 		 518 aa  210  7e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  27.78 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 647 aa  192  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 511 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 503 aa  140  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 539 aa  131  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.37 
 
 		 471 aa  124  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.21 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.27 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.27 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.27 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.49 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  25.05 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 471 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  25.05 
 
 		 471 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.8 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.84 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>