More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2614 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
132 aa  266  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  100 
 
 
132 aa  266  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  78.46 
 
 
132 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  78.46 
 
 
132 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  68.99 
 
 
133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  68.99 
 
 
133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.91 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.56 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  51.56 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  53.28 
 
 
124 aa  130  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.28 
 
 
129 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.78 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  36.36 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0812  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.29 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  40 
 
 
142 aa  76.6  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.68 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  33.85 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  31.97 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.06 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  30.33 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  26.32 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  29.92 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.13 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  30.3 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.39 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  34.01 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  34.01 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  25.81 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  34.01 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  34.01 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  34.01 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  34.01 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  34.01 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.16 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  33.33 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
137 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.88 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  30.66 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  30.53 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  32.85 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  30.95 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.94 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  32.85 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0736  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.5 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  32.85 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.16 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  34.01 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  32.37 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.37 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 
207 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  29.17 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
140 aa  59.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2301  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.17 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.54 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.86 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11800  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.54 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.13 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  28.68 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0898  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250835  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  31.54 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  30.66 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  31.16 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  33.59 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.25 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>