More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0756 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  100 
 
 		 562 aa  1141    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  41.06 
 
 		 559 aa  423  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  40.72 
 
 		 556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 573 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  38.42 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  40.5 
 
 		 555 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  38.98 
 
 		 583 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  39.15 
 
 		 579 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  38.98 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  38.62 
 
 		 579 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  38.98 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 579 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 579 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  38.98 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  38.45 
 
 		 579 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  38.98 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  38.82 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  36.49 
 
 		 566 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 570 aa  350  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.89 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 567 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 565 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 565 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 565 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.36 
 
 		 577 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  37.16 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.03 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.95 
 
 		 554 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 557 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 562 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 559 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 559 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.99 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 		 556 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 554 aa  321  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 558 aa  320  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 554 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  36 
 
 		 586 aa  317  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.51 
 
 		 565 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  35.61 
 
 		 572 aa  317  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 560 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.64 
 
 		 554 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 		 565 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 555 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 		 558 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 574 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  33.9 
 
 		 599 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 587 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  34.76 
 
 		 553 aa  309  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 575 aa  309  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 586 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.5 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.48 
 
 		 553 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  31.84 
 
 		 553 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  31.54 
 
 		 552 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  31.6 
 
 		 554 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  31.18 
 
 		 552 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 574 aa  296  5e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  30.7 
 
 		 552 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  31.91 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  31 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  31.19 
 
 		 553 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  30.88 
 
 		 552 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 		 586 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  30.88 
 
 		 552 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  30.88 
 
 		 552 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  30.88 
 
 		 552 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  33.2 
 
 		 582 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.13 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  30.34 
 
 		 552 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 569 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  31 
 
 		 574 aa  289  8e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  31.61 
 
 		 561 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.13 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 567 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  30.16 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  32.57 
 
 		 560 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  32.52 
 
 		 591 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  32.23 
 
 		 588 aa  286  8e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  30.95 
 
 		 553 aa  286  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  30.95 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  30.95 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  30.95 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  30.95 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  30.95 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  33.84 
 
 		 575 aa  284  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  31.24 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>